RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.83□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.83□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 PRR34Q9NV39 138 aa6.83□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 COX6CP09669 75 aa6.83□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.83□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 PRYO14603 147 aa6.82□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 ATXN8Q156A1 80 aa6.82□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.82□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 Q8NDZ9 215 aa6.82□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.82□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.81□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.81□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 NCR3O14931 201 aa6.81□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 LECT2O14960 151 aa6.81□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.8□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.8□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.8□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.8□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.8□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 TGP01266 2768 aa6.8□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.79□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.79□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 CASC10Q5T4H9 136 aa6.79□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 COPS9Q8WXC6 57 aa6.79□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 H3BNG1 76 aa6.79□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 PRO0628Q9UI54 55 aa6.78□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 LST1O00453 97 aa6.78□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.78□□□□□ -1.32
PSME3-201ENST00000293362 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.77□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 GAGE2EQ4V326 116 aa6.77□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 TEN1Q86WV5 123 aa6.77□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.77□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.77□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 A0A087WYN8 130 aa6.76□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 SLPIP03973 132 aa6.76□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.76□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 C1orf195Q5TG92 126 aa6.76□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.76□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 Q6ZRU5 148 aa6.76□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 GAGE2BQ13066 116 aa6.76□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 C15orf56Q8N910 161 aa6.76□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.75□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.75□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 CXCL5P42830 114 aa6.75□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 TTC32Q5I0X7 151 aa6.75□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.75□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 CD164Q04900 197 aa6.74□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.74□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.73□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 SNCGO76070 127 aa6.73□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.73□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.72□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.72□□□□□ -1.33
PSME3-201ENST00000293362 COX17Q14061 63 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 C6orf99Q4VX62 202 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 DNAL4O96015 105 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 Q6ZRP5 223 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.69□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.69□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.69□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 TMEM126AQ9H061 195 aa6.68□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 SYCNQ0VAF6 134 aa6.67□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.67□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 H3BT86 120 aa6.67□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 B9D2Q9BPU9 175 aa6.67□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 C22orf24Q9Y442 160 aa6.67□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 FBN3Q75N90 2809 aa6.67□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 FAM168BA1KXE4 195 aa6.66□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 TRACP01848 142 aa6.66□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 NDUFC2O95298 119 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 M0R2N4 97 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME3-201ENST00000293362 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 H0YGX0 51 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 PSCAO43653 123 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 FAM236CP0DP71 79 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 APLNQ9ULZ1 77 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 KMT2AQ03164 3969 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 C2orf48Q96LS8 159 aa6.62□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 Q8N814 137 aa6.62□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.61□□□□□ -1.35
PSME3-201ENST00000293362 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms