RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637383.1

SMARCA2-262, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	PRSS2	P07478	247 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	HERVK_113	P63121	156 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	SEC11A	P67812	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383		M0QXV9	152 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	S100P	P25815	95 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	CKS1B	P61024	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383		Q8IZM0	81 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383		F8VRH5	84 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383		H0Y9J4	135 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	UBE2B	P63146	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	CXCL5	P42830	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	RHEB	Q15382	184 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	COX19	Q49B96	90 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	PMVK	Q15126	192 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	TNXB	P22105	4242 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A096LNJ9	63 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383		H3BRM9	83 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF861P	O60384	105 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00614	P0C842	121 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	RAB5B	P61020	215 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	NUPR1	O60356	82 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	NDUFA6	P56556	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	LRP2	P98164	4655 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	ATP5L	O75964	103 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	HBD	P02042	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	APOC3	P02656	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	BCE1	O60756	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	SNAPIN	O95295	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	SVBP	Q8N300	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	PFN2	P35080	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	SCO1	O75880	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	COX17	Q14061	63 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCA2-262	ENST00000637383	VPREB1	P12018	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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