RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637106.1

VGLL3-204, Transcript of vestigial like family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene VGLL3, Length 1,240 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3-204ENST00000637106 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
VGLL3-204ENST00000637106 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.4□□□□□ -1.22
VGLL3-204ENST00000637106 H3BUA1 57 aa7.4□□□□□ -1.22
VGLL3-204ENST00000637106 SAA4P35542 130 aa7.4□□□□□ -1.22
VGLL3-204ENST00000637106 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.4□□□□□ -1.22
VGLL3-204ENST00000637106 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.4□□□□□ -1.22
VGLL3-204ENST00000637106 CR1P17927 2039 aa7.39□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.39□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.39□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 Q8N9W7 124 aa7.39□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 CUBNO60494 3623 aa7.39□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 K7EMT4 169 aa7.38□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 NACAE9PAV3 2078 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 TMEM89A2RUT3 159 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 A8MZ25 164 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 INAFM1C9JVW0 142 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 IGKV2D-28P01615 120 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 SS18Q15532 418 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 USMG5Q96IX5 58 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 MDFIQ99750 246 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.37□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 PRYO14603 147 aa7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 DAD1P61803 113 aa7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 IL17DQ8TAD2 202 aa7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 SNURFQ9Y675 71 aa7.36□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.35□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 PAX4O43316 350 aa7.35□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 NREPQ16612 68 aa7.35□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 Q6ZQT0 140 aa7.35□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.35□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 Q8N814 137 aa7.35□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.35□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.35□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 ATP6V0E1O15342 81 aa7.34□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 NDUFS5O43920 106 aa7.34□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 ECSCRQ19T08 205 aa7.34□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 C6orf223Q8N319 242 aa7.34□□□□□ -1.23
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 E7EQL1 145 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 K7EQD1 137 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3-53P01767 116 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 RETNQ9HD89 108 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 PLXNB1O43157 2135 aa7.33□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 MUC4Q99102 2169 aa7.32□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.32□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.32□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 UBE2BP63146 152 aa7.32□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 Q6ZVQ6 151 aa7.32□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.32□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 COX7B2Q8TF08 81 aa7.32□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.32□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 CCL18P55774 89 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 COX6A2Q02221 97 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 BSPH1Q075Z2 132 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 Q6ZTC4 211 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 Q8N3U1 123 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.31□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 A0A087WZ39 114 aa7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 hDV103S1A0JD37 113 aa7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 DSCR9P59020 149 aa7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.3□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 ANK2Q01484 3957 aa7.29□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.29□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 LINC00158P58513 81 aa7.29□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 MUC7Q8TAX7 377 aa7.29□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.29□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 BPY2O14599 106 aa7.28□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 HAMPP81172 84 aa7.28□□□□□ -1.24
VGLL3-204ENST00000637106 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms