RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625980.2

SPTAN1-211, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 1,713 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-211ENST00000625980 RMI2Q96E14 147 aa8.54□□□□□ -1.04
SPTAN1-211ENST00000625980 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SPTAN1-211ENST00000625980 GCSHP23434 173 aa8.53□□□□□ -1.04
SPTAN1-211ENST00000625980 HERV-K104P63124 156 aa8.53□□□□□ -1.04
SPTAN1-211ENST00000625980 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
SPTAN1-211ENST00000625980 M0R2N4 97 aa8.52□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 SMIM13P0DJ93 91 aa8.52□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 CKS1BP61024 79 aa8.52□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 TAL2Q16559 108 aa8.52□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.52□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 C10orf25Q5T742 122 aa8.52□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 CEND1Q8N111 149 aa8.52□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 DAND5Q8N907 189 aa8.52□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 TMEM238C9JI98 176 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 C3orf84H3BNL1 204 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 FXYD2P54710 66 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 TIMM17BO60830 172 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 TTC32Q5I0X7 151 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 LECT2O14960 151 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 CXCL5P42830 114 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 NPC2P61916 151 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 TM2D2Q9BX73 214 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 USP17L23D6RBM5 183 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 LY6G6CO95867 125 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 PFN2P35080 140 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 SPANXCQ9NY87 97 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 WFDC2Q14508 124 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 SFTA2Q6UW10 78 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 ERG28Q9UKR5 140 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 COX11Q9Y6N1 276 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 KMT2AQ03164 3969 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 LINC00158P58513 81 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 PTTG1IPP53801 180 aa8.47□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 PSCAO43653 123 aa8.46□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.46□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 Q6ZR54 194 aa8.46□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 Q6ZRU5 148 aa8.46□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.46□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.46□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.46□□□□□ -1.05
SPTAN1-211ENST00000625980 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 Q6ZVH6 145 aa8.46□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.46□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 C2orf48Q96LS8 159 aa8.46□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.46□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 SLPIP03973 132 aa8.45□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 A4D1N5 150 aa8.44□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 K7ERJ3 54 aa8.44□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.44□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 DNAH2Q9P225 4427 aa8.44□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 IFITM1P13164 125 aa8.43□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 SYCNQ0VAF6 134 aa8.43□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.42□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 A6NDN8 102 aa8.42□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 COX17Q14061 63 aa8.42□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.41□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 F8WDY8 70 aa8.41□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 CFC1BP0CG36 223 aa8.41□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 CFC1P0CG37 223 aa8.41□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.4□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 A0A1B0GWB2 263 aa8.4□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 A6NJY4 79 aa8.4□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 TAX1BP3O14907 124 aa8.4□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 RAB37Q96AX2 223 aa8.4□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 CARD19Q96LW7 228 aa8.4□□□□□ -1.06
SPTAN1-211ENST00000625980 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.39□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.37□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 COPS9Q8WXC6 57 aa8.37□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.37□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.37□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.37□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.36□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.36□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 RNF151Q2KHN1 245 aa8.36□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 Q6ZRP5 223 aa8.36□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.36□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 Q8NDZ9 215 aa8.36□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.36□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.36□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 A0A0B4J2C4 111 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 GAGE2EQ4V326 116 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 C14orf177Q52M58 125 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-211ENST00000625980 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms