RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GV90 55 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH7Q8WXX0 4024 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL24P83731 157 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP161Q6P656 301 aa15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 CKS1BP61024 79 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 SPAG11BQ08648 103 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 COX11Q9Y6N1 276 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 COPS9Q8WXC6 57 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.17■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 RMI2Q96E14 147 aa15.17■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH1Q9P2D7 4330 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 A4D1N5 150 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf82Q6UX34 121 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf118A6NHY6 69 aa15.15■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 K7ERJ3 54 aa15.15■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 ERG28Q9UKR5 140 aa15.15■□□□□ 0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 CFC1BP0CG36 223 aa15.14■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 CFC1P0CG37 223 aa15.14■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 DAND5Q8N907 189 aa15.14■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 Q9HAA7 133 aa15.14■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0B4J2C4 111 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 COX17Q14061 63 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 C15orf56Q8N910 161 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0U1RRA0 63 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 F8WDY8 70 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00158P58513 81 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.11■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.11■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB37Q96AX2 223 aa15.11■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 C6orf223Q8N319 242 aa15.1■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf48Q96LS8 159 aa15.1■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC7Q8TAX7 377 aa15.09■□□□□ 0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 NPC2P61916 151 aa15.08■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 C10orf25Q5T742 122 aa15.08■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.08■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa15.08■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa15.07■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa15.07■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 PFN2P35080 140 aa15.07■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL17AQ8IVW1 177 aa15.07■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 PRO1854Q9UHT4 67 aa15.07■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.06■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 CSMD3Q7Z407 3707 aa15.06■□□□□ 0
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.05■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BUT2 72 aa15.05■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.05■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS13DQ5THJ4 4388 aa15.05■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 TGP01266 2768 aa15.05■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 STARD9Q9P2P6 4700 aa15.04■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC32Q5I0X7 151 aa15.04■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.03■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PPM0 123 aa15.02■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMK2N2Q96S95 79 aa15.02■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa15.02■□□□□ -0
CAPNS1-207ENST00000589146 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPAN13O95857 204 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 CASC10Q5T4H9 136 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L23D6RBM5 183 aa15□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 VAMP3Q15836 100 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZRU5 148 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 FABP2P12104 132 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 SYCNQ0VAF6 134 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF151Q2KHN1 245 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFC2O95298 119 aa14.93□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2V1Q13404 147 aa14.93□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV2D-28P01615 120 aa14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.91□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 K7EP34 96 aa14.91□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 SLPIP03973 132 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 CARD19Q96LW7 228 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.89□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.89□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 SPCS1Q9Y6A9 102 aa14.89□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE10A6NGK3 116 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 TLX1NBP0CAT3 122 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 LYSTQ99698 3801 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 C3orf84H3BNL1 204 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 PSCAO43653 123 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 H7C2G1 150 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 Q1RN00 199 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZR54 194 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118 ms