RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.62□□□□□ -0.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf82Q6UX34 121 aa10.62□□□□□ -0.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa10.62□□□□□ -0.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.61□□□□□ -0.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.61□□□□□ -0.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00469Q8N7U9 141 aa10.6□□□□□ -0.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 CST9LQ9H4G1 147 aa10.6□□□□□ -0.71
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.59□□□□□ -0.71
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM168BA1KXE4 195 aa10.54□□□□□ -0.72
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.5□□□□□ -0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPINK8P0C7L1 97 aa10.49□□□□□ -0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFA6P56556 154 aa10.49□□□□□ -0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE2BP63146 152 aa10.48□□□□□ -0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.38□□□□□ -0.75
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CCNDBP1-211ENST00000567434 LRP2P98164 4655 aa10.36□□□□□ -0.75
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PFN2P35080 140 aa10.35□□□□□ -0.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.35□□□□□ -0.75
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CCNDBP1-211ENST00000567434 BCE1O60756 84 aa10.33□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM19A2Q8N3H0 131 aa10.33□□□□□ -0.76
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CCNDBP1-211ENST00000567434 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa10.32□□□□□ -0.76
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CCNDBP1-211ENST00000567434 LEPROTL1O95214 131 aa10.31□□□□□ -0.76
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.3□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.29□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.29□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPB8Q9UJY1 196 aa10.29□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAGE10A6NGK3 116 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPREB1P12018 145 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00310P59036 64 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLNP26678 52 aa10.27□□□□□ -0.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 HERV-K104P63124 156 aa10.27□□□□□ -0.77
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