RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		1.07	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WWC5	75 aa		1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GUT8	65 aa		1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	S100Z	Q8WXG8	99 aa		1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	LTN1	O94822	1766 aa		1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		1.06	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCA4	P78363	2273 aa		1.05	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		1.05	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		1.05	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		1.05	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA1B	Q00975	2339 aa		1.05	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3C2B	O00750	1634 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	C5	P01031	1676 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFB1	O75438	58 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINT3	P49223	89 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINK7	P58062	85 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		1.04	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	PI4KA	P42356	2102 aa		1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	LYNX1	P0DP58	116 aa		1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	GNGT1	P63211	74 aa		1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JMZ2	1700 aa		1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		1.03	□□□□□ -2.24
AKAP13-223	ENST00000560957	TIAM1	Q13009	1591 aa		1.02	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMA4	Q16363	1823 aa		1.02	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	MADD	Q8WXG6	1647 aa		1.02	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	ESPL1	Q14674	2120 aa		1.01	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH4	Q9Y623	1939 aa		1.01	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LRP6	O75581	1613 aa		1.01	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	USP32	Q8NFA0	1604 aa		1.01	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE6A	A0A183	80 aa		1.01	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		1.01	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	COX8A	P10176	69 aa		1.01	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GU69	56 aa		1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	S100A3	P33764	101 aa		1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	HAMP	P81172	84 aa		1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPPA	Q13219	1627 aa		1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		0.99	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WXM4	84 aa		0.99	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINK9	Q5DT21	86 aa		0.99	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		0.99	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		0.99	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	ITSN1	Q15811	1721 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0556	O60303	1618 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMC1	P11047	1609 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZSA8	131 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	SLIT1	O75093	1534 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTB	P11277	2137 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		0.98	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	NHS	Q6T4R5	1651 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	PREX2	Q70Z35	1606 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	IFI6	P09912	130 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	EEA1	Q15075	1411 aa		0.97	□□□□□ -2.25
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		0.96	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		0.96	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		0.96	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN8	Q156A1	80 aa		0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB123	Q8N688	67 aa		0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	GAFA1	Q96PS6	74 aa		0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	CNFN	Q9BYD5	112 aa		0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		0.95	□□□□□ -2.26
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		0.94	□□□□□ -2.26

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