RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 CXCL5P42830 114 aa11.42□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 SFTA2Q6UW10 78 aa11.42□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 C6orf223Q8N319 242 aa11.42□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 C15orf56Q8N910 161 aa11.42□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0U1RRA0 63 aa11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM238C9JI98 176 aa11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSD52Q0P140 79 aa11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 BATFQ16520 125 aa11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE6AA0A183 80 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L23D6RBM5 183 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 LECT2O14960 151 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 GCSHP23434 173 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMIM13P0DJ93 91 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAL2Q16559 108 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAH1Q9P2D7 4330 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 M0R143 59 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 TIMM17BO60830 172 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 PFN2P35080 140 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC00158P58513 81 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEND1Q8N111 149 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAND5Q8N907 189 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 LITAFQ99732 161 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERG28Q9UKR5 140 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPC2P61916 151 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 C10orf25Q5T742 122 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTTG1IPP53801 180 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 C2orf48Q96LS8 159 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPANXCQ9NY87 97 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 EREGO14944 169 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 KMT2AQ03164 3969 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q6ZRU5 148 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q6ZVH6 145 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 FXYD2P54710 66 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYCNQ0VAF6 134 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 WFDC2Q14508 124 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 F8WDY8 70 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 COX17Q14061 63 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFITM1P13164 125 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 A6NJY4 79 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 C14orf177Q52M58 125 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 COPS9Q8WXC6 57 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 CARD19Q96LW7 228 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 A6NDN8 102 aa11.27□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 A4D1N5 150 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLPIP03973 132 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.25□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.25□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa11.23□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A087WTM6 91 aa11.22□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTL8CO15255 209 aa11.22□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.22□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 K7ERJ3 54 aa11.21□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF151Q2KHN1 245 aa11.21□□□□□ -0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.21□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAGE2EQ4V326 116 aa11.21□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB37Q96AX2 223 aa11.21□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.21□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFC1BP0CG36 223 aa11.2□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFC1P0CG37 223 aa11.2□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q8N814 137 aa11.19□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.19□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNP2Q05952 138 aa11.18□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q6ZRP5 223 aa11.18□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.18□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.17□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.16□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.16□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1B0GWB2 263 aa11.16□□□□□ -0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms