RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 A0A087WXM4 84 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 COX8AP10176 69 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB112Q30KQ8 113 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 Q8IZM0 81 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 USMG5Q96IX5 58 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 HIGD1BQ9P298 99 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 CACNA1EQ15878 2313 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 ATP10BO94823 1461 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC141Q6ZP82 1450 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 PLXNB2O15031 1838 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1B0GUT8 65 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 CEBPZOSA8MTT3 80 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 IQCF6A8MYZ5 107 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 PRH1P02810 166 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 CRIPTQ9P021 101 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 TULP4Q9NRJ4 1543 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 MYO7BQ6PIF6 2116 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 SPTBN2O15020 2390 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 F8P00451 2351 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 NLRP1Q9C000 1473 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 BTAF1O14981 1849 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 I3L2K1 104 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 I3L3M4 83 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 SPINK1P00995 79 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00643Q86TS7 51 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 WFDC9Q8NEX5 89 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 ST20Q9HBF5 79 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 APCP25054 2843 aa0.65□□□□□ -2.3
TMOD3-202ENST00000558300 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 NMSQ5H8A3 153 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 GAFA1Q96PS6 74 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 NDUFB1O75438 58 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 HEPN1Q6WQI6 88 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 SMR3AQ99954 134 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 C2CD3Q4AC94 2353 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 MON2Q7Z3U7 1717 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 H3BUT2 72 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 IGLC2P0DOY2 106 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 IGLC3P0DOY3 106 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 COX6B1P14854 86 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 WFDC2Q14508 124 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 MYO3AQ8NEV4 1616 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 A0A0G2JMZ2 1700 aa0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 PAPPAQ13219 1627 aa0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 SCRIBQ14160 1630 aa0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 CUX1P39880 1505 aa0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 LOC730098B7Z3J9 87 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 H3BVH4 76 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 SPINK4O60575 86 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 SMIM13P0DJ93 91 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 SHPRHQ149N8 1683 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 DEFA5Q01523 94 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB109BQ30KR1 87 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 Q5BKY6 102 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB123Q8N688 67 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 GNG13Q9P2W3 67 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 APLNQ9ULZ1 77 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 MED14O60244 1454 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 TDRG1Q3Y452 100 aa0.59□□□□□ -2.31
TMOD3-202ENST00000558300 DNAJC13O75165 2243 aa0.58□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 TRAV21A0A0B4J279 112 aa0.58□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 UMAD1C9J7I0 102 aa0.58□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 CCL22O00626 93 aa0.58□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 COX7BP24311 80 aa0.58□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB105AQ8NG35 78 aa0.58□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 PLCE1Q9P212 2302 aa0.57□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa0.57□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 SMCO4Q9NRQ5 59 aa0.57□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa0.57□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 NHSL1Q5SYE7 1610 aa0.56□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 CLIP1P30622 1438 aa0.56□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 KNDC1Q76NI1 1749 aa0.56□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.56□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 K7EQZ3 153 aa0.56□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 PDCD5O14737 125 aa0.56□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa0.56□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 SAMD9Q5K651 1589 aa0.56□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 CHD9Q3L8U1 2897 aa0.55□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms