RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.6□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV2D-28P01615 120 aa5.6□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 Q8IZM0 81 aa5.6□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.6□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.6□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.59□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 TEX46H3BTG2 121 aa5.59□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 PCOTHQ58A44 107 aa5.59□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.59□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.59□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.58□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 F8VRH5 84 aa5.58□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 C20orf78Q9BR46 151 aa5.58□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 HIGD1CA8MV81 97 aa5.57□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 CT83Q5H943 113 aa5.57□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.57□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.57□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.56□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 RIGQ13278 110 aa5.56□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.56□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM141Q96I45 108 aa5.56□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 SPRR4Q96PI1 79 aa5.56□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.56□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM126AQ9H061 195 aa5.56□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00862A6NCI5 91 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM238C9JI98 176 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 SLC25A20O43772 301 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 SCO1O75880 301 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 Q8N377 158 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.55□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 CXCL5P42830 114 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF345Q14585 488 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 CKS2P33552 79 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM5A-211ENST00000544777 M0R378 163 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 RAB5AP20339 215 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 RAB5BP61020 215 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 SMLR1H3BR10 107 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 CFC1P0CG37 223 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 LINC01551Q86U37 167 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 VCX2Q9H322 139 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 HERVK_113P63121 156 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 LCE3BQ5TA77 95 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 AMELXQ99217 191 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 D6R8Y8 96 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 NPYP01303 97 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 SEC11AP67812 179 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 HMSDA8MTL9 139 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM250H0YL14 139 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 VPREB1P12018 145 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 COX7B2Q8TF08 81 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 OSTCQ9NRP0 149 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM5A-211ENST00000544777 C9orf92A6NGG3 77 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 CEBPGP53567 150 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 MOBPQ13875 183 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.45□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.45□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 AKAP14Q86UN6 197 aa5.45□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 V9GYV3 84 aa5.45□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 A0A1B0GW15 77 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 GHRHP01286 108 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 PPBPP02775 128 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 PFN2P35080 140 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 F8W036 122 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 NPSP0C0P6 89 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 RAB14P61106 215 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00483Q53H64 154 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.42□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 ATP5LO75964 103 aa5.42□□□□□ -1.54
KDM5A-211ENST00000544777 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms