RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 PTPRBP23467 1997 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFC2O95298 119 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 PTPN13Q12923 2485 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 C20orf197Q8N268 126 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 H3BNG1 76 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRB-204ENST00000538708 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-204ENST00000538708 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.56□□□□□ -1.36
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PTPRB-204ENST00000538708 K7EIL1 84 aa6.56□□□□□ -1.36
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PTPRB-204ENST00000538708 SPINK1P00995 79 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-204ENST00000538708 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-204ENST00000538708 A8MTW9 85 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRB-204ENST00000538708 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-204ENST00000538708 NOTCH2Q04721 2471 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-204ENST00000538708 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-204ENST00000538708 YPEL4Q96NS1 127 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-204ENST00000538708 CRYGAP11844 174 aa6.52□□□□□ -1.36
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PTPRB-204ENST00000538708 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-204ENST00000538708 Q8N3U1 123 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRB-204ENST00000538708 IGKV2-30P06310 120 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-204ENST00000538708 PCSK5Q92824 1860 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-204ENST00000538708 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA0087Q14695 138 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-204ENST00000538708 IGF2RP11717 2491 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-204ENST00000538708 Q8NBF4 154 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-204ENST00000538708 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRB-204ENST00000538708 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRB-204ENST00000538708 PLXNB1O43157 2135 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 A0A096LNT2 108 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 IMUPQ9GZP8 106 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00313P59037 77 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 Q96NJ1 140 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-204ENST00000538708 hDV103S1A0JD37 113 aa6.42□□□□□ -1.38
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