RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 ERC2-IT1O76042 136 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 Q6YL49 198 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 FLNCQ14315 2725 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 AVPP01185 164 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 LINC00575Q6W349 94 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 A0A1B0GUV1 79 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-215ENST00000537304 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.51□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZVQ6 151 aa7.51□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.51□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 HAMPP81172 84 aa7.51□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 DEFB136Q30KP8 78 aa7.51□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 A0A096LNT2 108 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 F8WEM9 126 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 C6orf99Q4VX62 202 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 FSHBP01225 129 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 MIFP14174 115 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 SPG11Q96JI7 2443 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 F8WDY8 70 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 CCL24O00175 119 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-215ENST00000537304 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 C16orf95Q9H693 158 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 LRRK2Q5S007 2527 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 COL12A1Q99715 3063 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 Q8N3U1 123 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 RMI2Q96E14 147 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 NREPQ16612 68 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 SNURFQ9Y675 71 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 SORL1Q92673 2214 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP10-9P60411 292 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 KIAA0087Q14695 138 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 IGLV6-57P01721 117 aa7.43□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 PLA2G2AP14555 144 aa7.43□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.43□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 BPY2O14599 106 aa7.42□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.42□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 DIRC1Q969H9 104 aa7.42□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZQY7 126 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-215ENST00000537304 A0A0J9YWU9 116 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 J3QKU1 62 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 GYPEP15421 78 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 COX7BP24311 80 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 PRYO14603 147 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 PRO0255Q9UI72 69 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 PTPN13Q12923 2485 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 BRK1Q8WUW1 75 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 FBN2P35556 2912 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 A0A1B0GW54 56 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 ESRGQ1W209 222 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 C1orf195Q5TG92 126 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-215ENST00000537304 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms