RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534793.1

TTC12-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 12, human

TSL 5

Gene TTC12, Length 342 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC12-222	ENST00000534793	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793		F8WDY8	70 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793	NCR3	O14931	201 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793	C3orf56	Q8N813	242 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC12-222	ENST00000534793	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	DMD	P11532	3685 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	LINC00575	Q6W349	94 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C20orf197	Q8N268	126 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	ESM1	Q9NQ30	184 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	MGA	Q8IWI9	3026 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		A0A087WVE0	104 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		A0A0U1RRA0	63 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	OXT	P01178	125 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	EDN2	P20800	178 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	ATRX	P46100	2492 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	CR1	P17927	2039 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		A0A0J9YWU9	116 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	HTN1	P15515	57 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		Q6ZTI0	123 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		Q6ZVQ6	151 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		A0A096LNT2	108 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	MIF	P14174	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	COX7B	P24311	80 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		Q9UF83	564 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	DIRC1	Q969H9	104 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C16orf95	Q9H693	158 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	AKAP13	Q12802	2813 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	LRBA	P50851	2863 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		F8WEM9	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	HILS1	P60008	231 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	NREP	Q16612	68 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	ESRG	Q1W209	222 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	C10orf25	Q5T742	122 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		V9GYY9	64 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	LCE6A	A0A183	80 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC12-222	ENST00000534793		A0A0U1RQV1	116 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC12-222	ENST00000534793	BPY2	O14599	106 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC12-222	ENST00000534793	NDUFB1	O75438	58 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC12-222	ENST00000534793	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms