RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 F8VRH5 84 aa8.57□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 SFTA2Q6UW10 78 aa8.57□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.57□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.57□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.57□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 J3KT08 172 aa8.57□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 BAALCQ8WXS3 180 aa8.57□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 RTL8CO15255 209 aa8.56□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.56□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.56□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.56□□□□□ -1.04
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RPUSD4-208ENST00000533628 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.55□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.55□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
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RPUSD4-208ENST00000533628 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 H7C423 109 aa8.53□□□□□ -1.04
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RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF815PA8K554 130 aa8.53□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.53□□□□□ -1.04
RPUSD4-208ENST00000533628 KLK12Q9UKR0 248 aa8.53□□□□□ -1.04
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RPUSD4-208ENST00000533628 A4D1N5 150 aa8.52□□□□□ -1.05
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RPUSD4-208ENST00000533628 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.51□□□□□ -1.05
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RPUSD4-208ENST00000533628 A0A087WTM6 91 aa8.42□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.42□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 IGIPA6NJ69 53 aa8.42□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
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RPUSD4-208ENST00000533628 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.42□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 ACYP1P07311 99 aa8.41□□□□□ -1.06
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