RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 HBDP02042 147 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.25□□□□□ -1.25
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UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
UBASH3B-208ENST00000533451 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
UBASH3B-208ENST00000533451 FABP4P15090 132 aa7.17□□□□□ -1.26
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UBASH3B-208ENST00000533451 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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UBASH3B-208ENST00000533451 M0QXV9 152 aa7.16□□□□□ -1.26
UBASH3B-208ENST00000533451 LEPROTL1O95214 131 aa7.16□□□□□ -1.26
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UBASH3B-208ENST00000533451 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.15□□□□□ -1.26
UBASH3B-208ENST00000533451 PFN2P35080 140 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 NUPR1O60356 82 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf137Q5JT78 98 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.12□□□□□ -1.27
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UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BJP06899 126 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BOP23527 126 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BBP33778 126 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BDP58876 126 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BCP62807 126 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.12□□□□□ -1.27
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