RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD42-209ENST00000533342 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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ANKRD42-209ENST00000533342 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ANKRD42-209ENST00000533342 K7EMI3 77 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-209ENST00000533342 TIMM17AQ99595 171 aa6.72□□□□□ -1.33
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ANKRD42-209ENST00000533342 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.71□□□□□ -1.34
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ANKRD42-209ENST00000533342 HERVK_113P63121 156 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-209ENST00000533342 S100A12P80511 92 aa6.69□□□□□ -1.34
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ANKRD42-209ENST00000533342 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.68□□□□□ -1.34
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ANKRD42-209ENST00000533342 F8WDY8 70 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-209ENST00000533342 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-209ENST00000533342 C1orf137Q5JT78 98 aa6.67□□□□□ -1.34
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ANKRD42-209ENST00000533342 SEC11AP67812 179 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-209ENST00000533342 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.66□□□□□ -1.34
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ANKRD42-209ENST00000533342 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
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ANKRD42-209ENST00000533342 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD42-209ENST00000533342 C11orf86A6NJI1 115 aa6.62□□□□□ -1.35
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ANKRD42-209ENST00000533342 TRGC2P03986 189 aa6.61□□□□□ -1.35
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ANKRD42-209ENST00000533342 IGLV7-43P04211 117 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD42-209ENST00000533342 PFN2P35080 140 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.6□□□□□ -1.35
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ANKRD42-209ENST00000533342 C22orf24Q9Y442 160 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD42-209ENST00000533342 GAGE10A6NGK3 116 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD42-209ENST00000533342 H3BRM9 83 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD42-209ENST00000533342 ATP5LO75964 103 aa6.59□□□□□ -1.35
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ANKRD42-209ENST00000533342 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 NUPR1O60356 82 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 LINC00310P59036 64 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A0U1RRA0 63 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 HSBP1O75506 76 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 SERF1AO75920 110 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 KRTAP10-8P60410 259 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 LINC00167Q96N53 147 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42-209ENST00000533342 COLCA2A8K830 154 aa6.55□□□□□ -1.36
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