RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523364.1

HOXA-AS2-209, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXA-AS2, Length 989 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMEM141Q96I45 108 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PEA15Q15121 130 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C9JQL5 133 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 K7EMI3 77 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TSPAN13O95857 204 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AMELXQ99217 191 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC00310P59036 64 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C2orf82Q6UX34 121 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 Q6ZN92 141 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 Q8IZM0 81 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRELID3AQ96N28 172 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRSS2P07478 247 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SEC11AP67812 179 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CKS1BP61024 79 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 Q8N8P6 123 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 VCX2Q9H322 139 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C22orf24Q9Y442 160 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGIPA6NJ69 53 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 F8VRH5 84 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 G0S2P27469 103 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CXCL5P42830 114 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 HERVK_113P63121 156 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 BCE1O60756 84 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CTAG1AP78358 180 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CDIP1Q9H305 208 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CRYGAP11844 174 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TIMM17AQ99595 171 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 A0A087X002 238 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC01549A6NIU2 74 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MT-ND4LP03901 98 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TOMM6Q96B49 74 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC00167Q96N53 147 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ERASQ7Z444 233 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TPRXLQ17RH7 258 aa6.41□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 COX7B2Q8TF08 81 aa6.41□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC01546A6NGU7 62 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UBE2AP49459 152 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CST9LQ9H4G1 147 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ATP5LO75964 103 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GAGE10A6NGK3 116 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 H3BRM9 83 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ADCYAP1P18509 176 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 COX17Q14061 63 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PMVKQ15126 192 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.35□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.35□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 A0A1B0GVG6 124 aa6.35□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MT1HP80294 61 aa6.35□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.35□□□□□ -1.39
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SPINK8P0C7L1 97 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms