RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 COX7B2Q8TF08 81 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 PRSS2P07478 247 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 TTC32Q5I0X7 151 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 HIGD1BQ9P298 99 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 COX11Q9Y6N1 276 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-210ENST00000519815 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFA1O15239 70 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 Q8IZM0 81 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 HERV-K104P63124 156 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 CFAP161Q6P656 301 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 SFTA2Q6UW10 78 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 TM2D2Q9BX73 214 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0J9YXY3 114 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 CKS1BP61024 79 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 CXCL5P42830 114 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 KIAA0087Q14695 138 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 LY6G6CO95867 125 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 GCSHP23434 173 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 PCP4P48539 62 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 SPAG11BQ08648 103 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM238C9JI98 176 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 TIMM17BO60830 172 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 HSD52Q0P140 79 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 TAL2Q16559 108 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 C2orf82Q6UX34 121 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 HIST1H4GQ99525 98 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 F8WDY8 70 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 PSCAO43653 123 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 C15orf56Q8N910 161 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-210ENST00000519815 TGP01266 2768 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 USP17L23D6RBM5 183 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 M0R2N4 97 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZR54 194 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 C6orf223Q8N319 242 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 C2orf48Q96LS8 159 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 SMIM13P0DJ93 91 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZVH6 145 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 CEND1Q8N111 149 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 LITAFQ99732 161 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00158P58513 81 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 COX17Q14061 63 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 SPANXCQ9NY87 97 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 ERG28Q9UKR5 140 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0U1RRA0 63 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 IFITM1P13164 125 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 PFN2P35080 140 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 BATFQ16520 125 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 C10orf25Q5T742 122 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 TENM2Q9NT68 2774 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 LECT2O14960 151 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 SYCNQ0VAF6 134 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 C14orf177Q52M58 125 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 COPS9Q8WXC6 57 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZRU5 148 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 DAND5Q8N907 189 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-210ENST00000519815 A6NDN8 102 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 FXYD2P54710 66 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.82□□□□□ -1.32
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