RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 CRYGAP11844 174 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 C3orf79P0CE67 100 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 LAMA5O15230 3695 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFC2O95298 119 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR2J3-215ENST00000511313 COX6A2Q02221 97 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A1B0GV90 55 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 GAGE10A6NGK3 116 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 AMELXQ99217 191 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM223A0PJW6 202 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 PRR34Q9NV39 138 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 ATRQ13535 2644 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A0U1RQV1 116 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 DLEU1O43261 78 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 AGRNO00468 2067 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A1B0GV72 72 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 HIGD1BQ9P298 99 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 NCR3O14931 201 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 PRM2P04554 102 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 BSNQ9UPA5 3926 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 COX8AP10176 69 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 IGIPA6NJ69 53 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC01620Q4KN68 170 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 MAST4O15021 2626 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 ATOH7Q8N100 152 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 NPC2P61916 151 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 C10orf25Q5T742 122 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 hADV29S1A0JD25 119 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 Q6ZRU5 148 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 TRACP01848 142 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 XGP55808 180 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 FOXI1Q12951 378 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 ENHOQ6UWT2 76 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 BCE1O60756 84 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 PYY3Q5JQD4 70 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 YPEL4Q96NS1 127 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 UBL5Q9BZL1 73 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 CFC1BP0CG36 223 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 CFC1P0CG37 223 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 SCGB1A1P11684 91 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 C22orf24Q9Y442 160 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 OXTP01178 125 aa6.46□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.46□□□□□ -1.37
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00694P0DN24 101 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 C2orf82Q6UX34 121 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A0B4J2C4 111 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 TNP2Q05952 138 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 C14orf144Q96I85 54 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC01546A6NGU7 62 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 C9JAW5 83 aa6.45□□□□□ -1.38
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