RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495530.5

PTPRE-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRE, Length 987 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-211ENST00000495530 COX7B2Q8TF08 81 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 VAMP8Q9BV40 100 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 SMIM6P0DI80 62 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 CKS1BP61024 79 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 SPAG11BQ08648 103 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 SFTA2Q6UW10 78 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 C15orf56Q8N910 161 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 J3QQQ9 107 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 LECT2O14960 151 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 CXCL5P42830 114 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 C2orf48Q96LS8 159 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 A0A087WTM6 91 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 RTL8CO15255 209 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 NMUP48645 174 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 KIAA0087Q14695 138 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 MAJINQ3KP22 176 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 NDUFA1O15239 70 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 SPATA45Q537H7 98 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRE-211ENST00000495530 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 HERV-K104P63124 156 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 Q8N814 137 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 CDK2AP2O75956 126 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 TNP2Q05952 138 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 SYCNQ0VAF6 134 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 WFDC2Q14508 124 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 LINC00587B1AMM8 73 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 Q8N1X5 172 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 RNF151Q2KHN1 245 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 C2orf82Q6UX34 121 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 ZNF815PA8K554 130 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 CARD19Q96LW7 228 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 C12orf57Q99622 126 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 COX8AP10176 69 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 Q6ZRU5 148 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRE-211ENST00000495530 DLEU1O43261 78 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 SLPIP03973 132 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 COX17Q14061 63 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 PCP2Q8IVA1 136 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 C10orf25Q5T742 122 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 C14orf144Q96I85 54 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 A0A0J9YXY3 114 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 ERG28Q9UKR5 140 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 LINC00158P58513 81 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 TIMM17BO60830 172 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRE-211ENST00000495530 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 PFN2P35080 140 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 TMEM238C9JI98 176 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 TSTD3H0UI37 97 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 SMIM13P0DJ93 91 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 GCSHP23434 173 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 Q6ZVH6 145 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 HIGD1BQ9P298 99 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 C16orf90A8MZG2 172 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP10-2P60368 255 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 COPS9Q8WXC6 57 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRE-211ENST00000495530 A0A0U1RRA0 63 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms