RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495517.5

RBM41-208, Transcript of RNA binding motif protein 41, human

TSL 2

Gene RBM41, Length 3,315 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM41-208	ENST00000495517		J3QQQ9	107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	PAX4	O43316	350 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	SLC25A20	O43772	301 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	F8	P00451	2351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517		A0A087WZ39	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	GAGE5	Q13069	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	GAGE6	Q13070	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517		A0A0J9YWU9	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	CXCL5	P42830	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	IFITM1	P13164	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	NDUFA1	O15239	70 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	PRM2	P04554	102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	COX17	Q14061	63 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	VWF	P04275	2813 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	LST1	O00453	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	MIA	Q16674	131 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	ACAN	P16112	2415 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517		H3BT86	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517		Q8IZM0	81 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	HERVK_113	P61574	105 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517		Q9UF83	564 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RBM41-208	ENST00000495517	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67	6e-7	■■□□□ 12.1
RBM41-208	ENST00000495517	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517		Q6ZTC4	211 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517		C9JAW5	83 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517		Q6ZVQ6	151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	GAGE4	Q13068	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517		A0A0J9YXV3	536 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	UBE2L6	O14933	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	ESRG	Q1W209	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	OXT	P01178	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	PRSS2	P07478	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	SS18	Q15532	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	RMI2	Q96E14	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM41-208	ENST00000495517	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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