RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 EMX2Q04743 252 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TMEM78Q5T7P6 136 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 C3orf33Q6P1S2 294 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 STX12Q86Y82 276 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 OTOSQ8NHW6 89 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 BOLA2Q9H3K6 86 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 CBLN4Q9NTU7 201 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 GID8Q9NWU2 228 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 ABCC8Q09428 1581 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 PRXQ9BXM0 1461 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 H3BSH0 61 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 PYYP10082 97 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 LXNQ9BS40 222 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 MED31Q9Y3C7 131 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 VPS8Q8N3P4 1428 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-0.64□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 MYH7P12883 1935 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 MYH6P13533 1939 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 A0A1W2PRE2 83 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 PPP5D1E7EU14 171 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 HBDP02042 147 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 ADCYAP1P18509 176 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 CKS2P33552 79 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TMEM141Q96I45 108 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.65□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 ROCK1Q13464 1354 aa-0.66□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 NMBP08949 121 aa-0.66□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 NDUFA11Q86Y39 141 aa-0.66□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 THEM6Q8WUY1 208 aa-0.66□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.66□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 CCDC32Q9BV29 185 aa-0.66□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.66□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 K7EP34 96 aa-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 PITX3O75364 302 aa-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 OR2H2O95918 312 aa-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 APOC1P02654 83 aa-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-0.68□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-0.68□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 FAM92AA1XBS5 289 aa-0.68□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 G0S2P27469 103 aa-0.68□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.68□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 TSTD1Q8NFU3 115 aa-0.68□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.69□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 TRIQKQ629K1 86 aa-0.69□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 CDC26Q8NHZ8 85 aa-0.69□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-0.69□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.69□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 S4R3F8 94 aa-0.69□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 RBAKDNA6NC62 111 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 UQCRQO14949 82 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 APODP05090 189 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 PCBD1P61457 104 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 MED23Q9ULK4 1368 aa-0.7□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-0.71□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-0.71□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 FAM107AO95990 144 aa-0.71□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 GNG10P50151 68 aa-0.71□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 UBE2D3P61077 147 aa-0.71□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.71□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-0.71□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 DEFB108AA8MXU0 73 aa-0.72□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 E7EQ34 232 aa-0.72□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 PFDN1O60925 122 aa-0.72□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 TCRAP04437 139 aa-0.72□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 HTN3P15516 51 aa-0.72□□□□□ -2.52
CMC1-211ENST00000495428 WFDC2Q14508 124 aa-0.72□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms