RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 KIAA0087Q14695 138 aa3.45□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 Q8N1X5 172 aa3.45□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.45□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 HERC2O95714 4834 aa3.45□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 A0A0J9YXV3 536 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 SYCNQ0VAF6 134 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 PMCHL1Q16048 86 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 RNF151Q2KHN1 245 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 BAGE3Q86Y29 109 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 CARD19Q96LW7 228 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.44□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 HSBP1O75506 76 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 SPAG11BQ08648 103 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 Q6ZRU5 148 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 SCXQ7RTU7 201 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 HSPG2P98160 4391 aa3.43□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 EPM2AB3EWF7 344 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 PANO1I0J062 215 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 NDUFA1O15239 70 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 NUPR1O60356 82 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 SERF1AO75920 110 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 IGLC3P0DOY3 106 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 S100A2P29034 98 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 Q8IZM0 81 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.42□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 A0A087WYN8 130 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 A0A096LNI7 61 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 H3BRM9 83 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 LEPROTL1O95214 131 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 PRSS2P07478 247 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 CHTF8P0CG12 524 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 PTTG1IPP53801 180 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 HAMPP81172 84 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 C10orf25Q5T742 122 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 DPH3Q96FX2 82 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SRPRB-205ENST00000494297 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 C11orf86A6NJI1 115 aa3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 F8VRH5 84 aa3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 CXCL5P42830 114 aa3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 CKS1BP61024 79 aa3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 MAJINQ3KP22 176 aa3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 C2orf82Q6UX34 121 aa3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.4□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM223A0PJW6 202 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 SPINK8P0C7L1 97 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 AKR1D1P51857 326 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 GAGE2BQ13066 116 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 ODF1Q14990 250 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 Q5VSD8 79 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 Q6ZRP5 223 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 STPG4Q8N801 248 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 COX7B2Q8TF08 81 aa3.39□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.38□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 A0A1W2PNN7 141 aa3.38□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.38□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 FABP4P15090 132 aa3.38□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.38□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.38□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 PLNP26678 52 aa3.37□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 SFTA2Q6UW10 78 aa3.37□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.36□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 H0Y8G0 127 aa3.36□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.36□□□□□ -1.87
SRPRB-205ENST00000494297 DPM2O94777 84 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms