RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-215ENST00000490753 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 LECT2O14960 151 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 LEPROTO15243 131 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 CIDEAO60543 219 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 FXYD2P54710 66 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 LINC01620Q4KN68 170 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 TM2D2Q9BX73 214 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.39□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 A0A1W2PPM0 123 aa6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 J3QQQ9 107 aa6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 K7EP34 96 aa6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 UBE2L6O14933 153 aa6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.38□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 A0A0J9YXV3 536 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 K7ERJ3 54 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 Q8N3U1 123 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 TMEM101Q96IK0 257 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 TMEM223A0PJW6 202 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 TMEM238C9JI98 176 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 LELP1Q5T871 98 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 GAGE12JA6NER3 117 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 GAGE4Q13068 117 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 GAGE5Q13069 117 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 GAGE13Q4V321 117 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.34□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 APOMO95445 188 aa6.34□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 LCE2CQ5TA81 110 aa6.34□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 Q6ZUT4 128 aa6.34□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 AMELXQ99217 191 aa6.34□□□□□ -1.39
NOP56-215ENST00000490753 RNF213Q63HN8 5207 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 LRP2P98164 4655 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 TMEM243Q9BU79 118 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 K7ERU9 68 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 HERVK_113P63121 156 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 RNF151Q2KHN1 245 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 SPINK8P0C7L1 97 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 UBE2D3P61077 147 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 UBE2D2P62837 147 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 Q1RN00 199 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 H7C423 109 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 MT1HL1P0DM35 61 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 LINC00694P0DN24 101 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 PSMB2P49721 201 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 UBE2D1P51668 147 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 COPS9Q8WXC6 57 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 A0A1B0GWB2 263 aa6.29□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 VPS25Q9BRG1 176 aa6.29□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.29□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 Q9UF83 564 aa6.29□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.29□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.28□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.28□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 A0A0J9YXY3 114 aa6.28□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 PRSS2P07478 247 aa6.28□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.28□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 RMI2Q96E14 147 aa6.28□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
NOP56-215ENST00000490753 F8W1H4 67 aa6.27□□□□□ -1.41
NOP56-215ENST00000490753 J3QR89 54 aa6.27□□□□□ -1.41
NOP56-215ENST00000490753 TSPAN13O95857 204 aa6.27□□□□□ -1.41
NOP56-215ENST00000490753 GAGE6Q13070 117 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.3 ms