RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 BAGE3Q86Y29 109 aa11.09□□□□□ -0.63
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PTPRN-217ENST00000489650 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
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PTPRN-217ENST00000489650 M0QXV9 152 aa11.06□□□□□ -0.64
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PTPRN-217ENST00000489650 C2orf82Q6UX34 121 aa11.02□□□□□ -0.65
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PTPRN-217ENST00000489650 TMEM141Q96I45 108 aa11.01□□□□□ -0.65
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PTPRN-217ENST00000489650 HIST1H2BJP06899 126 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-217ENST00000489650 HIST1H2BOP23527 126 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-217ENST00000489650 HIST1H2BBP33778 126 aa11□□□□□ -0.65
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PTPRN-217ENST00000489650 PDZD11Q5EBL8 140 aa10.92□□□□□ -0.66
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PTPRN-217ENST00000489650 A0A096LNJ9 63 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRN-217ENST00000489650 PMVKQ15126 192 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRN-217ENST00000489650 A0A087X002 238 aa10.89□□□□□ -0.67
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PTPRN-217ENST00000489650 IFI27L1Q96BM0 104 aa10.89□□□□□ -0.67
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PTPRN-217ENST00000489650 S100A2P29034 98 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRN-217ENST00000489650 HERVK_113P63121 156 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRN-217ENST00000489650 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRN-217ENST00000489650 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRN-217ENST00000489650 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.84□□□□□ -0.67
PTPRN-217ENST00000489650 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PTPRN-217ENST00000489650 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.84□□□□□ -0.67
PTPRN-217ENST00000489650 CRYGAP11844 174 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRN-217ENST00000489650 Q8IZM0 81 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRN-217ENST00000489650 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10.82□□□□□ -0.68
PTPRN-217ENST00000489650 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.82□□□□□ -0.68
PTPRN-217ENST00000489650 BCE1O60756 84 aa10.82□□□□□ -0.68
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