RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 C3orf84H3BNL1 204 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 H3BUT2 72 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 PRSS2P07478 247 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 IFITM1P13164 125 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 MALP21145 153 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXI1Q12951 378 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 VAMP3Q15836 100 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 ENHOQ6UWT2 76 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8IZM0 81 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC7Q8TAX7 377 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2WQ96B02 151 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 A4D1N5 150 aa7.02□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.02□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CASC10Q5T4H9 136 aa7.02□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 COPS9Q8WXC6 57 aa7.02□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLL5B9A064 214 aa7.01□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 APOMO95445 188 aa7.01□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.01□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0B4J2C4 111 aa7□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PPM0 123 aa7□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CFC1BP0CG36 223 aa7□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CFC1P0CG37 223 aa7□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CXCL5P42830 114 aa7□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL18P55774 89 aa7□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CFAP161Q6P656 301 aa7□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0U1RRA0 63 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 FABP2P12104 132 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CKS1BP61024 79 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 NPC2P61916 151 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2V1Q13404 147 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 DAND5Q8N907 189 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 SPAG11BQ08648 103 aa6.98□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA0087Q14695 138 aa6.98□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.98□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TENM2Q9NT68 2774 aa6.98□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 K7EP34 96 aa6.97□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPAN13O95857 204 aa6.97□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00158P58513 81 aa6.97□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 UPK3BQ9BT76 320 aa6.97□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.97□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 ERG28Q9UKR5 140 aa6.97□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.97□□□□□ -1.29
GTPBP1-211ENST00000487538 KMT2AQ03164 3969 aa6.96□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 GAGE10A6NGK3 116 aa6.96□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.96□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 C2orf82Q6UX34 121 aa6.96□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.96□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.96□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.96□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.96□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 PFN2P35080 140 aa6.95□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.94□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.94□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 LCE6AA0A183 80 aa6.94□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 NUPR2A6NF83 97 aa6.94□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 COX17Q14061 63 aa6.94□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.94□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 APLNQ9ULZ1 77 aa6.94□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 H7C2G1 150 aa6.93□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 Q1RN00 199 aa6.93□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 RMI2Q96E14 147 aa6.93□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.93□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.92□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.92□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.92□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 C6orf223Q8N319 242 aa6.92□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 Q9HAA7 133 aa6.92□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.92□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.91□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMB2P49721 201 aa6.91□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.91□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 C15orf56Q8N910 161 aa6.91□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.91□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 F8WDY8 70 aa6.9□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.9□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 C10orf25Q5T742 122 aa6.9□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.9□□□□□ -1.3
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAH2Q9P225 4427 aa6.89□□□□□ -1.31
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.89□□□□□ -1.31
GTPBP1-211ENST00000487538 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.89□□□□□ -1.31
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GTPBP1-211ENST00000487538 C2orf48Q96LS8 159 aa6.89□□□□□ -1.31
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.89□□□□□ -1.31
GTPBP1-211ENST00000487538 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.89□□□□□ -1.31
GTPBP1-211ENST00000487538 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.88□□□□□ -1.31
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