RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486641.2

CCDC171-208, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC171, Length 2,322 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171-208ENST00000486641 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.37□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 B4DSR2 109 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 CCL19Q99731 98 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 C6orf99Q4VX62 202 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 Q6ZVQ6 151 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 AKAP9Q99996 3911 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 PLA2G2AP14555 144 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 LINC00575Q6W349 94 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC171-208ENST00000486641 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 Q8IZM0 81 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 Q8NDZ9 215 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 C6orf223Q8N319 242 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 Q8N3U1 123 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 A0A1W2PRX2 142 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 ZNF843Q8N446 348 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 CXCL6P80162 114 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 Q6YL49 198 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 SCXQ7RTU7 201 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 SPG11Q96JI7 2443 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 NDUFC1O43677 76 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 MIFP14174 115 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 KIAA0087Q14695 138 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 BRK1Q8WUW1 75 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 C16orf74Q96GX8 76 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 IGF2RP11717 2491 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 COX17Q14061 63 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC171-208ENST00000486641 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 ZANQ9Y493 2812 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 A0A0U1RQV1 116 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 F8WDY8 70 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 Q6ZQY7 126 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 MUC7Q8TAX7 377 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 CHD6Q8TD26 2715 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 GNLYP22749 145 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 NREPQ16612 68 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 PDE6GP18545 87 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 A0A1B0GUV1 79 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 BPY2O14599 106 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 C1orf195Q5TG92 126 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 A0A096LPF7 62 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 IGLV6-57P01721 117 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 GYPEP15421 78 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 ITPR1Q14643 2758 aa7.21□□□□□ -1.25
CCDC171-208ENST00000486641 DEFB130BP0DP73 79 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 DEFB130AP0DP74 79 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 C10orf25Q5T742 122 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 CR1P17927 2039 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 FSHBP01225 129 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 Q8N9L7 120 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 LINC01006Q8NI28 216 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 FBN2P35556 2912 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 ERC2-IT1O76042 136 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.19□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 PRB1P04280 392 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 H3BQ85 93 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 DSCR9P59020 149 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 Q6ZTC4 211 aa7.18□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 V9GYY9 64 aa7.18□□□□□ -1.26
CCDC171-208ENST00000486641 CCL24O00175 119 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms