RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486068.1

OPHN1-204, Transcript of oligophrenin 1, humanhuman

TSL 5

Gene OPHN1, Length 120 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1-204ENST00000486068 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 GRIN2AQ12879 1464 aa-1.05□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-1.05□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 SMIM21Q3B7S5 101 aa-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 PFDN5Q99471 154 aa-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 LINC00474Q9P2X8 69 aa-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 ZZEF1O43149 2961 aa-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 A0A1B0GWA3 101 aa-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 H3BNG1 76 aa-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 ARPC4P59998 168 aa-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 DR1Q01658 176 aa-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 NLRP1Q9C000 1473 aa-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 SCN7AQ01118 1682 aa-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 CEP152O94986 1710 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 A0A1B0GU69 56 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 BTG2P78543 158 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 CATR1Q13166 79 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 MEIG1Q5JSS6 88 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 SFTA2Q6UW10 78 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 C5orf38Q86SI9 138 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 ARL11Q969Q4 196 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 TRANK1O15050 2925 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 SHROOM2Q13796 1616 aa-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 REV3LO60673 3130 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 ACACAQ13085 2346 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 NUP188Q5SRE5 1749 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 RYR2Q92736 4967 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 FAM25AB3EWG3 89 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 FAM25CB3EWG5 89 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 FAM25GB3EWG6 89 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 Q56UQ5 140 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 LELP1Q5T871 98 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 C9orf153Q5TBE3 101 aa-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-1.1□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.58
OPHN1-204ENST00000486068 ADGRL2O95490 1459 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 TRAPPC2P0DI81 140 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 SNCAP37840 140 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 MANBALQ9NQG1 85 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 DNAH2Q9P225 4427 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 KALRNO60229 2985 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 CUBNO60494 3623 aa-1.1□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 CCL22O00626 93 aa-1.11□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 APOC2P02655 101 aa-1.11□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 GNG11P61952 73 aa-1.11□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.11□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.11□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-1.11□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 PHLPP1O60346 1717 aa-1.12□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 Q0VG73 95 aa-1.12□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-1.12□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.12□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 FOCADQ5VW36 1801 aa-1.12□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 A0A087WVE0 104 aa-1.13□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 GNG7O60262 68 aa-1.13□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 COX6CP09669 75 aa-1.13□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 LINC00846Q9NV44 126 aa-1.13□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.13□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 TOP2BQ02880 1626 aa-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 OOSP1A8MZH6 123 aa-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 F6UZH7 168 aa-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 C12orf57Q99622 126 aa-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 LINC00470Q9BZP3 86 aa-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-1.15□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-1.15□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-1.15□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 DNAH11Q96DT5 4516 aa-1.15□□□□□ -2.59
OPHN1-204ENST00000486068 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-1.15□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms