RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 MTURNQ8N3F0 131 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2WQ96B02 151 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 LYSTQ99698 3801 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 K7EMI3 77 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 LEPROTL1O95214 131 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 REG3AQ06141 175 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 ENHOQ6UWT2 76 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 BAALCQ8WXS3 180 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM101Q96IK0 257 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 UPK3BQ9BT76 320 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0J9YXV3 536 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 E9PLD3 99 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 C3orf79P0CE67 100 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 G0S2P27469 103 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 KRTDAPP60985 99 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 COX6A2Q02221 97 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZN92 141 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM141Q96I45 108 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 CST9LQ9H4G1 147 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 CCL25O15444 150 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 ATP5LO75964 103 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 CRPP02741 224 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 XCL1P47992 114 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 PMVKQ15126 192 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 C5orf38Q86SI9 138 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 AMELXQ99217 191 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TIMM17AQ99595 171 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 LCE6AA0A183 80 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 LECT2O14960 151 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2D1P51668 147 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 AKR1D1P51857 326 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 PKIAP61925 76 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 SS18Q15532 418 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 ATOH7Q8N100 152 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
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PTPRC-211ENST00000484135 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf86A6NJI1 115 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 MIAQ16674 131 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 KMT2AQ03164 3969 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01549A6NIU2 74 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 F8VRH5 84 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 PSCAO43653 123 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 SPINK8P0C7L1 97 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC2Q14508 124 aa3.07□□□□□ -1.92
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