RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481331.1

ATXN2-208, Transcript of ataxin 2, human

TSL 3

Gene ATXN2, Length 381 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN2-208	ENST00000481331	OXT	P01178	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	UBE2D1	P51668	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	HERVK_113	P63121	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	STPG4	Q8N801	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331		A0A096LNI7	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	APOC3	P02656	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331		Q6ZRU5	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN2-208	ENST00000481331	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	RAB5B	P61020	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	PRSS2	P07478	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	LINC00614	P0C842	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	CXCL5	P42830	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	CKS1B	P61024	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331		Q8IZM0	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	PRY	O14603	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	PMVK	Q15126	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331		Q6ZRP5	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331		H3BRM9	83 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	ATP5L	O75964	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	HBD	P02042	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	HERC1	Q15751	4861 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331		A0A0J9YXV3	536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331		F8VRH5	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331		A0A1W2PNN7	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN2-208	ENST00000481331	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331		A0A096LNJ9	63 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	NDUFA6	P56556	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	COX17	Q14061	63 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331		M0QXV9	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	HSBP1	O75506	76 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	UBE2B	P63146	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN2-208	ENST00000481331	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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