RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.38□□□□□ -0.91
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COX11Q9Y6N1 276 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.37□□□□□ -0.91
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 FXYD2P54710 66 aa9.36□□□□□ -0.91
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.36□□□□□ -0.91
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 VAMP3Q15836 100 aa9.32□□□□□ -0.92
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERG28Q9UKR5 140 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.28□□□□□ -0.92
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 APLNQ9ULZ1 77 aa9.27□□□□□ -0.93
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q9HAA7 133 aa9.24□□□□□ -0.93
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 C2orf82Q6UX34 121 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.21□□□□□ -0.94
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.2□□□□□ -0.94
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 PSCAO43653 123 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDUFC2O95298 119 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LY6G6CO95867 125 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C14orf177Q52M58 125 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.17□□□□□ -0.94
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SYCNQ0VAF6 134 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RNF151Q2KHN1 245 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C6orf223Q8N319 242 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C15orf56Q8N910 161 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.14□□□□□ -0.95
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