RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462166.1

TPRKB-204, Transcript of TP53RK binding protein, human

TSL 3

Gene TPRKB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRKB-204	ENST00000462166	MAJIN	Q3KP22	176 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166		A0A087WYN8	130 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	NDUFA6	P56556	154 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	C2orf48	Q96LS8	159 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	CST9L	Q9H4G1	147 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TPRKB-204	ENST00000462166	LINC01549	A6NIU2	74 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	COLCA2	A8K830	154 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	HERVK_113	P63121	156 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	GAGE2B	Q13066	116 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	PMVK	Q15126	192 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	C10orf25	Q5T742	122 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	NDUFA1	O15239	70 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	SEC11A	P67812	179 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	KIAA0087	Q14695	138 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	C2orf82	Q6UX34	121 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	BAGE3	Q86Y29	109 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	PRSS2	P07478	247 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	STPG4	Q8N801	248 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	ATP5L	O75964	103 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	SPINK8	P0C7L1	97 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	HSBP1	O75506	76 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	SERF1A	O75920	110 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166		F8WDY8	70 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	NUPR1	O60356	82 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	IGLC3	P0DOY3	106 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	CKS1B	P61024	79 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166		Q8IZM0	81 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TPRKB-204	ENST00000462166		A0A1W2PNN7	141 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	C11orf86	A6NJI1	115 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	GAGE2E	Q4V326	116 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166		Q6ZRP5	223 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166		H0Y8G0	127 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166		H3BRM9	83 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	COX7B2	Q8TF08	81 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	FAM168B	A1KXE4	195 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	C7orf33	Q8WU49	177 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BK	O60814	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	LEPROTL1	O95214	131 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	FABP4	P15090	132 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BO	P23527	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BB	P33778	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BD	P58876	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BC	P62807	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166		F8VRH5	84 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	CXCL5	P42830	114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	ATP6V1G1	O75348	118 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TPRKB-204	ENST00000462166	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36

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