RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC01549A6NIU2 74 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q8IZM0 81 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CKS1BP61024 79 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SVBPQ8N300 66 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.61□□□□□ -0.87
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.6□□□□□ -0.87
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1orf137Q5JT78 98 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC01600Q96MT4 127 aa9.57□□□□□ -0.88
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF861PO60384 105 aa9.38□□□□□ -0.91
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.37□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM223A0PJW6 202 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COX17Q14061 63 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCE1O60756 84 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC00310P59036 64 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SFTA2Q6UW10 78 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERF1AO75920 110 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.33□□□□□ -0.92
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPREB1P12018 145 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H0Y8G0 127 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LEPROTL1O95214 131 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGKV2D-28P01615 120 aa9.31□□□□□ -0.92
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