RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PMVKQ15126 192 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0J9YXV3 536 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTTG1IPP53801 180 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C10orf25Q5T742 122 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFA1O15239 70 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRGC2P03986 189 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP5LO75964 103 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCE1DQ5T752 114 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8IZM0 81 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLC3P0DOY3 106 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ODF1Q14990 250 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAJINQ3KP22 176 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STPG4Q8N801 248 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00310P59036 64 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PMCHL1Q16048 86 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZRP5 223 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DPH3Q96FX2 82 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1W2PNN7 141 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXCL5P42830 114 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2orf82Q6UX34 121 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAGE2BQ13066 116 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BAGE3Q86Y29 109 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F8VRH5 84 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSBP1O75506 76 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRSS2P07478 247 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H3BRM9 83 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SERF1AO75920 110 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CKS1BP61024 79 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COX7B2Q8TF08 81 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C7orf33Q8WU49 177 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C11orf86A6NJI1 115 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUPR1O60356 82 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCO1O75880 301 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BKO60814 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LEPROTL1O95214 131 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BJP06899 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPINK8P0C7L1 97 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BOP23527 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BBP33778 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFA6P56556 154 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BDP58876 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BCP62807 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OXTP01178 125 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM223A0PJW6 202 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAGE2EQ4V326 116 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SFTA2Q6UW10 78 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM168BA1KXE4 195 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COX17Q14061 63 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 S100A1P23297 94 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNXBP22105 4242 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms