RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 COL4A3Q01955 1670 aa4.85□□□□□ -1.63
USP46-201ENST00000441222 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.85□□□□□ -1.63
USP46-201ENST00000441222 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.85□□□□□ -1.63
USP46-201ENST00000441222 YPEL4Q96NS1 127 aa4.85□□□□□ -1.63
USP46-201ENST00000441222 C2orf48Q96LS8 159 aa4.84□□□□□ -1.63
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USP46-201ENST00000441222 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP46-201ENST00000441222 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.84□□□□□ -1.63
USP46-201ENST00000441222 Q6ZS46 218 aa4.84□□□□□ -1.63
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USP46-201ENST00000441222 Q8N3U1 123 aa4.84□□□□□ -1.63
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USP46-201ENST00000441222 Q8N2B8 174 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP46-201ENST00000441222 C6orf223Q8N319 242 aa4.82□□□□□ -1.64
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USP46-201ENST00000441222 Q6ZPA2 131 aa4.81□□□□□ -1.64
USP46-201ENST00000441222 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP46-201ENST00000441222 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.81□□□□□ -1.64
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USP46-201ENST00000441222 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
USP46-201ENST00000441222 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.8□□□□□ -1.64
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USP46-201ENST00000441222 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.79□□□□□ -1.64
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USP46-201ENST00000441222 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.79□□□□□ -1.64
USP46-201ENST00000441222 PSPHP1O15172 72 aa4.79□□□□□ -1.64
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USP46-201ENST00000441222 C16orf95Q9H693 158 aa4.77□□□□□ -1.65
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USP46-201ENST00000441222 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.77□□□□□ -1.65
USP46-201ENST00000441222 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.77□□□□□ -1.65
USP46-201ENST00000441222 Q6ZTC4 211 aa4.77□□□□□ -1.65
USP46-201ENST00000441222 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.77□□□□□ -1.65
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USP46-201ENST00000441222 SPINK1P00995 79 aa4.77□□□□□ -1.65
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USP46-201ENST00000441222 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.76□□□□□ -1.65
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USP46-201ENST00000441222 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.73□□□□□ -1.65
USP46-201ENST00000441222 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.73□□□□□ -1.65
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USP46-201ENST00000441222 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.72□□□□□ -1.65
USP46-201ENST00000441222 LINC00846Q9NV44 126 aa4.72□□□□□ -1.65
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USP46-201ENST00000441222 PRLHP81277 87 aa4.71□□□□□ -1.65
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USP46-201ENST00000441222 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.71□□□□□ -1.65
USP46-201ENST00000441222 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.71□□□□□ -1.66
USP46-201ENST00000441222 C8orf87E5RJ46 101 aa4.71□□□□□ -1.66
USP46-201ENST00000441222 Q6ZRU5 148 aa4.71□□□□□ -1.66
USP46-201ENST00000441222 LINC00313P59037 77 aa4.7□□□□□ -1.66
USP46-201ENST00000441222 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.7□□□□□ -1.66
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