RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440778.5

CCDC18-AS1-212, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RMI2Q96E14 147 aa4□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SPANXA1Q9NS26 97 aa4□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PANO1I0J062 215 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 COX19Q49B96 90 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TOMM6Q96B49 74 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TMEM101Q96IK0 257 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 AMELXQ99217 191 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.99□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRGC2P03986 189 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RAB5AP20339 215 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 UBE2D1P51668 147 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 XGP55808 180 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 COX6A2Q02221 97 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 UBE2V1Q13404 147 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 Q6ZSA8 131 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.98□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 K7EMI3 77 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NUPR1O60356 82 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TMEM141Q96I45 108 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TIMM17AQ99595 171 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.97□□□□□ -1.77
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CDK2AP2O75956 126 aa3.96□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FA2HQ7L5A8 372 aa3.96□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C5orf38Q86SI9 138 aa3.96□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 A0A0J9YXV3 536 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 COX7A2LO14548 114 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BKO60814 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SERF1AO75920 110 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BJP06899 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CHTF8P0CG12 524 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BOP23527 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BBP33778 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BDP58876 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BCP62807 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SS18Q15532 418 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HBDP02042 147 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LINC00614P0C842 121 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KIAA0087Q14695 138 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SCXQ7RTU7 201 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CST9LQ9H4G1 147 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TNXBP22105 4242 aa3.94□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.93□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 A0A087WZ39 114 aa3.93□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SPAG11BQ08648 103 aa3.93□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.93□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 Q6ZRU5 148 aa3.93□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.93□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.93□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 A0A096LNI7 61 aa3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGLC3P0DOY3 106 aa3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PMVKQ15126 192 aa3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C2orf82Q6UX34 121 aa3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 Q6ZN92 141 aa3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.92□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NDUFAF8A1L188 74 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C11orf86A6NJI1 115 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RAB5BP61020 215 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HERV-K104P63124 156 aa3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms