RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439875.1

FAM225B-202, Transcript of family with sequence similarity 225 member B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM225B, Length 7,380 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM225B-202ENST00000439875 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.44□□□□□ -1.22
FAM225B-202ENST00000439875 Q9BRP9 147 aa7.44□□□□□ -1.22
FAM225B-202ENST00000439875 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
FAM225B-202ENST00000439875 GAS8-AS1O95177 125 aa7.44□□□□□ -1.22
FAM225B-202ENST00000439875 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.44□□□□□ -1.22
FAM225B-202ENST00000439875 BRK1Q8WUW1 75 aa7.43□□□□□ -1.22
FAM225B-202ENST00000439875 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
FAM225B-202ENST00000439875 PTH2Q96A98 100 aa7.43□□□□□ -1.22
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FAM225B-202ENST00000439875 Q6ZRU5 148 aa7.42□□□□□ -1.22
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FAM225B-202ENST00000439875 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.4□□□□□ -1.22
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FAM225B-202ENST00000439875 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.36□□□□□ -1.23
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FAM225B-202ENST00000439875 Q8N814 137 aa7.35□□□□□ -1.23
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FAM225B-202ENST00000439875 Q6Q795 121 aa7.34□□□□□ -1.23
FAM225B-202ENST00000439875 YPEL4Q96NS1 127 aa7.34□□□□□ -1.23
FAM225B-202ENST00000439875 K7EIL1 84 aa7.34□□□□□ -1.23
FAM225B-202ENST00000439875 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.34□□□□□ -1.23
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FAM225B-202ENST00000439875 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.34□□□□□ -1.24
FAM225B-202ENST00000439875 AMELXQ99217 191 aa7.34□□□□□ -1.24
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FAM225B-202ENST00000439875 C20orf197Q8N268 126 aa7.32□□□□□ -1.24
FAM225B-202ENST00000439875 CHTF8P0CG12 524 aa7.32□□□□□ -1.24
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FAM225B-202ENST00000439875 A6NED7 52 aa7.31□□□□□ -1.24
FAM225B-202ENST00000439875 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.31□□□□□ -1.24
FAM225B-202ENST00000439875 MOBPQ13875 183 aa7.31□□□□□ -1.24
FAM225B-202ENST00000439875 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.31□□□□□ -1.24
FAM225B-202ENST00000439875 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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FAM225B-202ENST00000439875 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.26□□□□□ -1.25
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FAM225B-202ENST00000439875 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.24□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.24□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP10-3P60369 221 aa7.24□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 SPINK1P00995 79 aa7.24□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.24□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 LINC00575Q6W349 94 aa7.24□□□□□ -1.25
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FAM225B-202ENST00000439875 A0A0U1RQV1 116 aa7.23□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 UQCRQO14949 82 aa7.22□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 Q8N3U1 123 aa7.22□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.22□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.22□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.22□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.22□□□□□ -1.25
FAM225B-202ENST00000439875 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.21□□□□□ -1.26
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