RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6G6DO95868 133 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 MSMBP08118 114 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 CFHR3Q02985 330 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP9Q99996 3911 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN13Q12923 2485 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00158P58513 81 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 ESM1Q9NQ30 184 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 UBL5Q9BZL1 73 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 KLKP1Q107X0 134 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 CREBBPQ92793 2442 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZTI0 123 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 LYRM9A8MSI8 78 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL18P55774 89 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 COL12A1Q99715 3063 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 A6NDX4 124 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 BLCAPP62952 87 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 NBASA2RRP1 2371 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV1-40P01703 118 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6EQ16553 131 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 USMG5Q96IX5 58 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 HAMPP81172 84 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 FLNCQ14315 2725 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-53P01767 116 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 COX7B2Q8TF08 81 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 FBN2P35556 2912 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZRU5 148 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EQG2 157 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 APCP25054 2843 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R2N4 97 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N814 137 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MTW9 85 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 BCE1O60756 84 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 MIFP14174 115 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 Q75L30 129 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 REG3AQ06141 175 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N3U1 123 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 CUBNO60494 3623 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 SCXQ7RTU7 201 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFC1O43677 76 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6YL49 198 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZVQ6 151 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00167Q96N53 147 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2L6O14933 153 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZQT0 140 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRK2Q5S007 2527 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EQD1 137 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB131AP59861 70 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 INAFM1C9JVW0 142 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BUX3 64 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 MAST4O15021 2626 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087WZ39 114 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR15Q8IV56 129 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms