RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZRU5	148 aa		7.4	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		7.4	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A087WZ39	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		7.39	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		7.39	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDUFA4	O00483	81 aa		7.39	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCL18	P55774	89 aa		7.39	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HAMP	P81172	84 aa		7.39	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SORL1	Q92673	2214 aa		7.38	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HTN1	P15515	57 aa		7.38	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMO4	P61968	165 aa		7.38	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		7.38	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APC	P25054	2843 aa		7.38	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAX4	O43316	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00158	P58513	81 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ESRG	Q1W209	222 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q8N3U1	123 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A096LNT2	108 aa		7.36	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CD164	Q04900	197 aa		7.36	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00167	Q96N53	147 aa		7.36	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658		M0R2N4	97 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV3-11	P01762	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRM2	P04554	102 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q8N814	137 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		7.34	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZVQ6	151 aa		7.34	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CR1	P17927	2039 aa		7.34	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658		K7EQG2	157 aa		7.34	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NF1	P21359	2839 aa		7.34	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		7.34	□□□□□ -1.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZQT0	140 aa		7.33	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZTC4	211 aa		7.33	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.33	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NREP	Q16612	68 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTOR	P42345	2549 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C6orf223	Q8N319	242 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COX7B2	Q8TF08	81 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM89	A2RUT3	159 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LY6G6D	O95868	133 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DAD1	P61803	113 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDZD2	O15018	2839 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CXCL6	P80162	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV3-53	P01767	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCX	Q7RTU7	201 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AKAP9	Q99996	3911 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BPY2	O14599	106 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MSMB	P08118	114 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITPR3	Q14573	2671 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658		B4DSR2	109 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRY	O14603	147 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZRP5	223 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CREBBP	Q92793	2442 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658		K7EQD1	137 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERC2-IT1	O76042	136 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		7.26	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PSPHP1	O15172	72 aa		7.26	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		7.26	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q1T7F1	81 aa		7.26	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		7.25	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	hDV103S1	A0JD37	113 aa		7.25	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		7.25	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USMG5	Q96IX5	58 aa		7.25	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		7.24	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FSHB	P01225	129 aa		7.24	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25

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