RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 CELA1Q9UNI1 258 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 CRPP02741 224 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 SMIM11BQ8TCY0 68 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 PRO0255Q9UI72 69 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 A0A087WYN8 130 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 PAX4O43316 350 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 SNCGO76070 127 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 ATP5G1P05496 136 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 COPS9Q8WXC6 57 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
NISCH-202ENST00000420808 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10.71□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.7□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 HTN3P15516 51 aa10.7□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 GAGE2BQ13066 116 aa10.7□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 GAGE2EQ4V326 116 aa10.7□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.7□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GUV1 79 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 TRACP01848 142 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 SS18Q15532 418 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 C9orf66Q5T8R8 295 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 OR13C6PQ8NH95 151 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 SMCR5Q8TEV8 140 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 ANAPC13Q9BS18 74 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 SLPIP03973 132 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 SMIM9A6NGZ8 99 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 DAD1P61803 113 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 Q8NAQ8 132 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 Q8NDZ9 215 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 KIAA0087Q14695 138 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 LYRM9A8MSI8 78 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 TENM3Q9P273 2699 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-202ENST00000420808 REG3AQ06141 175 aa10.65□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 Q8IZM0 81 aa10.65□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 C6orf223Q8N319 242 aa10.65□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.65□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 LECT2O14960 151 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 MALP21145 153 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 C10orf25Q5T742 122 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.62□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.62□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.62□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
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NISCH-202ENST00000420808 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 RETNQ9HD89 108 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 CCDC179H3BU77 68 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 F8P00451 2351 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 NCR3O14931 201 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-202ENST00000420808 DNAL4O96015 105 aa10.59□□□□□ -0.71
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NISCH-202ENST00000420808 CFAP161Q6P656 301 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 Q6Q795 121 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 MIFP14174 115 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 B5MCH6 92 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 SPART-AS1P0CW21 52 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 H0YGX0 51 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 ENHOQ6UWT2 76 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 NOTCH1P46531 2555 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-202ENST00000420808 SPAG11BQ08648 103 aa10.52□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 LELP1Q5T871 98 aa10.52□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 MAST4O15021 2626 aa10.51□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa10.51□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa10.51□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.51□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-11P60412 298 aa10.51□□□□□ -0.73
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NISCH-202ENST00000420808 LINC01561Q8N1V8 128 aa10.51□□□□□ -0.73
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NISCH-202ENST00000420808 ACYP1P07311 99 aa10.51□□□□□ -0.73
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NISCH-202ENST00000420808 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.5□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.5□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 C6orf99Q4VX62 202 aa10.5□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.5□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 C3orf56Q8N813 242 aa10.5□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 LINC00643Q86TS7 51 aa10.49□□□□□ -0.73
NISCH-202ENST00000420808 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.49□□□□□ -0.73
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