RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.99□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.98□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.98□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.98□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 ATRQ13535 2644 aa9.98□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 PTPRBP23467 1997 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 A6NDX4 124 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 GNRH2O43555 120 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 USP24Q9UPU5 2620 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 A0A087WW49 117 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTIF-202ENST00000382998 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
CTIF-202ENST00000382998 Q6YL49 198 aa9.96□□□□□ -0.81
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CTIF-202ENST00000382998 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 NPBQ8NG41 125 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.96□□□□□ -0.82
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CTIF-202ENST00000382998 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 DIRC1Q969H9 104 aa9.95□□□□□ -0.82
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CTIF-202ENST00000382998 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.94□□□□□ -0.82
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CTIF-202ENST00000382998 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.93□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 B9D2Q9BPU9 175 aa9.93□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.93□□□□□ -0.82
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CTIF-202ENST00000382998 CTSGP08311 255 aa9.92□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 A0A087WYN8 130 aa9.91□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.91□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 ODF3BA8MYP8 253 aa9.91□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.9□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 SYCNQ0VAF6 134 aa9.9□□□□□ -0.82
CTIF-202ENST00000382998 A0A0A0MQY5 61 aa9.89□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.89□□□□□ -0.83
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CTIF-202ENST00000382998 ITPR3Q14573 2671 aa9.86□□□□□ -0.83
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CTIF-202ENST00000382998 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.85□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.85□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.85□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 C3orf84H3BNL1 204 aa9.85□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.85□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 PSCAO43653 123 aa9.84□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 ZNF580Q9UK33 172 aa9.84□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 A0A0J9YWU9 116 aa9.84□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.84□□□□□ -0.83
CTIF-202ENST00000382998 DEFB1P60022 68 aa9.84□□□□□ -0.83
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CTIF-202ENST00000382998 A0A096LPF7 62 aa9.82□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 Q1T7F1 81 aa9.82□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 FSHBP01225 129 aa9.82□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZQY7 126 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 K7ERS5 55 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 Q8N9L7 120 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 ERC2-IT1O76042 136 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 MED14OSP0DP75 135 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 hDV103S1A0JD37 113 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-202ENST00000382998 AKAP13Q12802 2813 aa9.79□□□□□ -0.84
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