RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ECSCRQ19T08 205 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 Q5VV11 94 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 UBL5Q9BZL1 73 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 UNC80Q8N2C7 3258 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 SZT2Q5T011 3432 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 C8orf87E5RJ46 101 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 F6UB75 175 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 GNRH2O43555 120 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 UBE2BP63146 152 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 SYCNQ0VAF6 134 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZS52 159 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 COL6A3P12111 3177 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 SORL1Q92673 2214 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WZ39 114 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 A8MTW9 85 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 C16orf90A8MZG2 172 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 H3BQ85 93 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 LECT2O14960 151 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 CRPP02741 224 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 COX6A2Q02221 97 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 DIRC1Q969H9 104 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 DNAH14Q0VDD8 3507 aa2.24□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 M0R2N4 97 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 PSCAO43653 123 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV4-1P06312 121 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 APELAP0DMC3 54 aa2.23□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZTI0 123 aa2.23□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 HTTP42858 3142 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.22□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 K7EMT4 169 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 LYPD2Q6UXB3 125 aa2.22□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 DEFB108BQ8NET1 73 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 SDK1Q7Z5N4 2213 aa2.22□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 CR1P17927 2039 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2AP49459 152 aa2.21□□□□□ -2.06
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PTPRC-202ENST00000367364 A8MUN3 132 aa2.2□□□□□ -2.06
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PTPRC-202ENST00000367364 C19orf84I3L1E1 186 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2L6O14933 153 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3-23P01764 117 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00575Q6W349 94 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-202ENST00000367364 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-202ENST00000367364 MUC7Q8TAX7 377 aa2.2□□□□□ -2.06
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