RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 PRO0461Q9UI25 63 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 BAHCC1Q9P281 2608 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 CDIP1Q9H305 208 aa13.75□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 MUC3AQ02505 3323 aa13.73□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.73□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.73□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa13.73□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 COX6A2Q02221 97 aa13.73□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa13.73□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 A0A096LNI7 61 aa13.72□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 hADV29S1A0JD25 119 aa13.72□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.71□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 SDIM1Q6ZPB5 146 aa13.71□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 A0A0J9YWU9 116 aa13.71□□□□□ -0.21
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC179H3BU77 68 aa13.71□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa13.7□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 CXCL5P42830 114 aa13.69□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 M0R2N4 97 aa13.68□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa13.68□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 KLK9Q2XQG4 91 aa13.67□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 ITPR2Q14571 2701 aa13.67□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 HIGD2AQ9BW72 106 aa13.67□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 Q6ZTC4 211 aa13.66□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 C6orf99Q4VX62 202 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 SMIM11BQ8TCY0 68 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 CDK2AP2O75956 126 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 DIRC1Q969H9 104 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD40-201ENST00000285243 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa13.64□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RBM3P98179 157 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 CITED1Q99966 193 aa13.64□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa13.64□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 IGKV2D-28P01615 120 aa13.64□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 UQCRQO14949 82 aa13.64□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 BEAN1Q3B7T3 259 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 FHL2Q14192 279 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 Q6Q795 121 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 IMUPQ9GZP8 106 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.61□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 CD164L2Q6UWJ8 174 aa13.61□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa13.6□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 ZANQ9Y493 2812 aa13.59□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
ANKRD40-201ENST00000285243 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.58□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 LELP1Q5T871 98 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 C3orf22Q8N5N4 141 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 J3KT08 172 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 M0QXV9 152 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 SYCNQ0VAF6 134 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 CYSRT1A8MQ03 144 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 UBE2AP49459 152 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 C16orf95Q9H693 158 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF575Q86XF7 245 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 COX7BP24311 80 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 RPL28P46779 137 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 TRAV10A0A0B4J240 114 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 SCXQ7RTU7 201 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD40-201ENST00000285243 RPL37AP8A6NKH3 93 aa13.52□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 Q8N2B8 174 aa13.52□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 CELA1Q9UNI1 258 aa13.52□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 NREPQ16612 68 aa13.51□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 C6orf223Q8N319 242 aa13.51□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ASPMQ8IZT6 3477 aa13.51□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 A0A087WZ39 114 aa13.5□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ENHOQ6UWT2 76 aa13.5□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 Q6ZQY7 126 aa13.5□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa13.5□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.5□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 UPK3BQ9BT76 320 aa13.5□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 C20orf197Q8N268 126 aa13.5□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.5□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 A0A087WYN8 130 aa13.49□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.49□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 USP17L23D6RBM5 183 aa13.48□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 Q8IZM0 81 aa13.47□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 LINC00337Q8N6G1 96 aa13.47□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 COX7CP15954 63 aa13.46□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 PDE6GP18545 87 aa13.46□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 PPDPFQ9H3Y8 114 aa13.46□□□□□ -0.25
ANKRD40-201ENST00000285243 NDUFS5O43920 106 aa13.46□□□□□ -0.26
ANKRD40-201ENST00000285243 H3BQ85 93 aa13.45□□□□□ -0.26
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa13.45□□□□□ -0.26
ANKRD40-201ENST00000285243 Q8N3U1 123 aa13.45□□□□□ -0.26
ANKRD40-201ENST00000285243 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.45□□□□□ -0.26
ANKRD40-201ENST00000285243 FHL3Q13643 280 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.2 ms