RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 M0QXV9 152 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 A6NED7 52 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 HRCT1Q6UXD1 115 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 M0R2N4 97 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf95Q9H693 158 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-9P60411 292 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 PRR3P79522 188 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 F8WDY8 70 aa15.06■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WVE0 104 aa15.06■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZSN1 163 aa15.06■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01561Q8N1V8 128 aa15.06■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 CELA1Q9UNI1 258 aa15.06■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.06■□□□□ 0
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.05■□□□□ -0
CCSAP-201ENST00000284617 TLN2Q9Y4G6 2542 aa15.05■□□□□ -0
CCSAP-201ENST00000284617 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-201ENST00000284617 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-201ENST00000284617 SERP1Q9Y6X1 66 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-201ENST00000284617 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-201ENST00000284617 REG3GQ6UW15 175 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf223Q8N319 242 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G2AP14555 144 aa15.01□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf48Q96LS8 159 aa15□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N3U1 123 aa15□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01546A6NGU7 62 aa14.99□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZTC4 211 aa14.98□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00208Q96KT6 92 aa14.98□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 RETNQ9HD89 108 aa14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 SMR3AQ99954 134 aa14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00575Q6W349 94 aa14.95□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 PRYO14603 147 aa14.94□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 NUPR2A6NF83 97 aa14.94□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 LY6G6CO95867 125 aa14.94□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.93□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.93□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.92□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 ESRGQ1W209 222 aa14.91□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00846Q9NV44 126 aa14.91□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZVQ6 151 aa14.9□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.9□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCSAP-201ENST00000284617 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.89□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00315P59091 139 aa14.88□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf195Q5TG92 126 aa14.87□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 Q9BRP9 147 aa14.87□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14.87□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.86□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 AGRNO00468 2067 aa14.86□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.86□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 CDIP1Q9H305 208 aa14.86□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS20P59510 1910 aa14.85□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WSZ3 146 aa14.85□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.84□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa14.84□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N2B8 174 aa14.83□□□□□ -0.03
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZRU5 148 aa14.83□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM254Q8TBM7 123 aa14.83□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL6P80162 114 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 A8MTW9 85 aa14.8□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.79□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.79□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 LRRK2Q5S007 2527 aa14.78□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.78□□□□□ -0.04
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.77□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 HCG22E2RYF7 251 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 H0Y9P7 68 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.75□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.73□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 PMAIP1Q13794 54 aa14.72□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 hDV103S1A0JD37 113 aa14.71□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 PCOTHQ58A44 107 aa14.71□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 C22orf24Q9Y442 160 aa14.71□□□□□ -0.05
CCSAP-201ENST00000284617 PRO0461Q9UI25 63 aa14.7□□□□□ -0.06
CCSAP-201ENST00000284617 PRLHP81277 87 aa14.68□□□□□ -0.06
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB116Q30KQ4 102 aa14.68□□□□□ -0.06
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.68□□□□□ -0.06
CCSAP-201ENST00000284617 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.67□□□□□ -0.06
CCSAP-201ENST00000284617 BCE1O60756 84 aa14.67□□□□□ -0.06
CCSAP-201ENST00000284617 FHL3Q13643 280 aa14.65□□□□□ -0.06
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0087Q14695 138 aa14.65□□□□□ -0.06
CCSAP-201ENST00000284617 PSPHP1O15172 72 aa14.64□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.63□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GW54 56 aa14.63□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 CRYGAP11844 174 aa14.63□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.63□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.62□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.61□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms