RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf195Q5TG92 126 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRR-201ENST00000283228 IGLV1-40P01703 118 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 V9GYY9 64 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 A8MTW9 85 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 STHQ8IWL8 128 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRR-201ENST00000283228 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.04□□□□□ -1.12
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PTPRR-201ENST00000283228 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRR-201ENST00000283228 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRR-201ENST00000283228 Q8N3U1 123 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRR-201ENST00000283228 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRR-201ENST00000283228 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRR-201ENST00000283228 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PRX2 142 aa8□□□□□ -1.13
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM89A2RUT3 159 aa8□□□□□ -1.13
PTPRR-201ENST00000283228 M0R2N4 97 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRR-201ENST00000283228 NAV2Q8IVL1 2488 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRR-201ENST00000283228 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRR-201ENST00000283228 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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PTPRR-201ENST00000283228 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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PTPRR-201ENST00000283228 CR1P17927 2039 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00575Q6W349 94 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 ESM1Q9NQ30 184 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.88□□□□□ -1.15
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