RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 Q8N6K4 173 aa10.35□□□□□ -0.75
SORCS1-201ENST00000263054 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa10.35□□□□□ -0.75
SORCS1-201ENST00000263054 MYO18BQ8IUG5 2567 aa10.35□□□□□ -0.75
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC179H3BU77 68 aa10.34□□□□□ -0.75
SORCS1-201ENST00000263054 XGP55808 180 aa10.34□□□□□ -0.75
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF580Q9UK33 172 aa10.34□□□□□ -0.75
SORCS1-201ENST00000263054 FSHBP01225 129 aa10.34□□□□□ -0.75
SORCS1-201ENST00000263054 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.34□□□□□ -0.75
SORCS1-201ENST00000263054 Q6ZSN1 163 aa10.33□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 Q8IZM0 81 aa10.33□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 LST1O00453 97 aa10.33□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 CACNA1AO00555 2505 aa10.33□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 C5orf42Q9H799 3197 aa10.32□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.32□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 FHL2Q14192 279 aa10.31□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 C2orf91Q6ZV80 131 aa10.31□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 Q9UF83 564 aa10.31□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 C2CD3Q4AC94 2353 aa10.31□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.3□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 C2orf48Q96LS8 159 aa10.3□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 Q8N814 137 aa10.3□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.28□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 LINC00575Q6W349 94 aa10.28□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 CHTF8P0CG12 524 aa10.28□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 PSPHP1O15172 72 aa10.28□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.28□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 IGKV2-30P06310 120 aa10.28□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 FN1P02751 2386 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
SORCS1-201ENST00000263054 PRO3102Q9H379 93 aa10.27□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 A0A087WVE0 104 aa10.27□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.27□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 LINC00337Q8N6G1 96 aa10.26□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 PCSK5Q92824 1860 aa10.26□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.26□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.26□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 CRYGAP11844 174 aa10.26□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 FSTL3O95633 263 aa10.26□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 IGLV1-51P01701 117 aa10.26□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 V9GYY9 64 aa10.25□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 A0A087WSZ3 146 aa10.25□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.25□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 A0A1W2PPR1 153 aa10.24□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.24□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.24□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.24□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 H0Y9P7 68 aa10.24□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 IGIPA6NJ69 53 aa10.23□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 Q6ZRU5 148 aa10.23□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 NDUFC1O43677 76 aa10.23□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.22□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 HCG22E2RYF7 251 aa10.22□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 IGF2RP11717 2491 aa10.21□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 MYO9AB2RTY4 2548 aa10.21□□□□□ -0.77
SORCS1-201ENST00000263054 MDFIQ99750 246 aa10.21□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.2□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 FHL3Q13643 280 aa10.19□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 COX7CP15954 63 aa10.18□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 MOBPQ13875 183 aa10.18□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 PMAIP1Q13794 54 aa10.17□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 C22orf24Q9Y442 160 aa10.16□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 SMCR5Q8TEV8 140 aa10.15□□□□□ -0.78
SORCS1-201ENST00000263054 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.15□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 YPEL4Q96NS1 127 aa10.14□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 C16orf95Q9H693 158 aa10.14□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 Q8N3U1 123 aa10.14□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 C1orf195Q5TG92 126 aa10.13□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.12□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.12□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 KIAA0087Q14695 138 aa10.11□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 Q6JHZ5 121 aa10.11□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 NAV2Q8IVL1 2488 aa10.1□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 TLN2Q9Y4G6 2542 aa10.1□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 C16orf90A8MZG2 172 aa10.09□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 LIMD2Q9BT23 127 aa10.09□□□□□ -0.79
SORCS1-201ENST00000263054 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.08□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 JMJD1CQ15652 2540 aa10.08□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 IMUPQ9GZP8 106 aa10.08□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 FAM229AH3BQW9 127 aa10.06□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 CNFNQ9BYD5 112 aa10.06□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 ABCA12Q86UK0 2595 aa10.05□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 SMIM29Q86T20 159 aa10.05□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.05□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.04□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.03□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 AMELXQ99217 191 aa10.03□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 hDV103S1A0JD37 113 aa10.03□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.03□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
SORCS1-201ENST00000263054 BPTFQ12830 3046 aa10.02□□□□□ -0.81
SORCS1-201ENST00000263054 NCOR2Q9Y618 2525 aa10.01□□□□□ -0.81
SORCS1-201ENST00000263054 A0A1B0GUV1 79 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.4 ms