RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.03□□□□□ -1.44
GINS1-201ENST00000262460 CCL18P55774 89 aa6.03□□□□□ -1.44
GINS1-201ENST00000262460 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.03□□□□□ -1.44
GINS1-201ENST00000262460 CELA1Q9UNI1 258 aa6.03□□□□□ -1.44
GINS1-201ENST00000262460 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.03□□□□□ -1.44
GINS1-201ENST00000262460 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.03□□□□□ -1.44
GINS1-201ENST00000262460 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 B5MCH6 92 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 CCDC179H3BU77 68 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 GAGE2BQ13066 116 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 GAGE2EQ4V326 116 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 TMEM86BQ8N661 226 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.02□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.01□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 C6orf223Q8N319 242 aa6.01□□□□□ -1.45
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GINS1-201ENST00000262460 C22orf24Q9Y442 160 aa6.01□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 X6R8D5 127 aa6.01□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.01□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 CITED1Q99966 193 aa6.01□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 COX7A2LO14548 114 aa6□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 ANGP03950 147 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 IFITM1P13164 125 aa6□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 GAGE2AQ6NT46 116 aa6□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 CRPP02741 224 aa6□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 FAM110AQ9BQ89 295 aa6□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 RETNQ9HD89 108 aa6□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 C14orf132Q9NPU4 83 aa6□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 J3QKU1 62 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 LECT2O14960 151 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 Q8NDZ9 215 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 NCR3O14931 201 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 TIMM17BO60830 172 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 SCGB1A1P11684 91 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 C10orf25Q5T742 122 aa5.98□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.97□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 TENM2Q9NT68 2774 aa5.97□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 C16orf95Q9H693 158 aa5.97□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.96□□□□□ -1.45
GINS1-201ENST00000262460 H3BT86 120 aa5.96□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WZ39 114 aa5.96□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.95□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 KLK12Q9UKR0 248 aa5.95□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.95□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 DAD1P61803 113 aa5.95□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 PRO0255Q9UI72 69 aa5.95□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 MALP21145 153 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 HERV-K104P63124 156 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 DNAL4O96015 105 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 SS18Q15532 418 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 REG3AQ06141 175 aa5.93□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.93□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 LYSTQ99698 3801 aa5.93□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WVE0 104 aa5.93□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.92□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.92□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.91□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.91□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.9□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 CXCL5P42830 114 aa5.9□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 KIAA0087Q14695 138 aa5.9□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.9□□□□□ -1.46
GINS1-201ENST00000262460 M0QXV9 152 aa5.9□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 C6orf99Q4VX62 202 aa5.9□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 LINC00846Q9NV44 126 aa5.9□□□□□ -1.47
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GINS1-201ENST00000262460 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.89□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 Q8NAQ8 132 aa5.89□□□□□ -1.47
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GINS1-201ENST00000262460 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 M0R2N4 97 aa5.88□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 SPAG11BQ08648 103 aa5.87□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.87□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.87□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 COPS9Q8WXC6 57 aa5.87□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.87□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.87□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 ENHOQ6UWT2 76 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 Q8IZM0 81 aa5.86□□□□□ -1.47
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