RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 COX6A2Q02221 97 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 IL17DQ8TAD2 202 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM1B2RUZ4 78 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PRM2P04554 102 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 DAND5Q8N907 189 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 B5MCH6 92 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 STARD9Q9P2P6 4700 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB4AO15263 64 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EQD1 137 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0J9YWU9 116 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 X6R8D5 127 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM222AQ5U5X8 452 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MEIG1Q5JSS6 88 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf158Q8N1D5 194 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SS18L2Q9UHA2 77 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-201ENST00000246533 F5H768 121 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC179H3BU77 68 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00694P0DN24 101 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8NAQ8 132 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00643Q86TS7 51 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 INAFM2P0DMQ5 153 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SDIM1Q6ZPB5 146 aa18.33■□□□□ 0.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TENM2Q9NT68 2774 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL28P46779 137 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM243Q9BU79 118 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2L6O14933 153 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 BAALC-AS2P0C853 105 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5G1P05496 136 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL5P42830 114 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC7Q8TAX7 377 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0U1RRA0 63 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CRPP02741 224 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MIFP14174 115 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZTI0 123 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM126AQ9H061 195 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CELA1Q9UNI1 258 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 COX7B2Q8TF08 81 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf74Q96GX8 76 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YGX0 51 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 MALP21145 153 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CHCHD5Q9BSY4 110 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 LYSTQ99698 3801 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM9A6NGZ8 99 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf45Q8TAV5 145 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM218AQ96MZ4 157 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 C22orf24Q9Y442 160 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PLAC8L1A1L4L8 177 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CASC10Q5T4H9 136 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SMCR5Q8TEV8 140 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAL4O96015 105 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf38Q86SI9 138 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00337Q8N6G1 96 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGV2A0A075B6R0 118 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf84H3BNL1 204 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV2D-28P01615 120 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZTC4 211 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WZ39 114 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00158P58513 81 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCRQO14949 82 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 GAGE2AQ6NT46 116 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf22Q8N5N4 141 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM11BQ8TCY0 68 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SPART-AS1P0CW21 52 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL18P55774 89 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TOMM7Q9P0U1 55 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 Q9HAA7 133 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SACSQ9NZJ4 4579 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB130BP0DP73 79 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB130AP0DP74 79 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00526Q96FQ7 95 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01561Q8N1V8 128 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ATOX1O00244 68 aa18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.2 ms