RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A0J9YWU9 116 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 A8MZ25 164 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 EML5Q05BV3 1969 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 H0Y9J4 135 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 Q8N2B8 174 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 C7orf33Q8WU49 177 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00310P59036 64 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 LST1O00453 97 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 UPK3BQ9BT76 320 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 FHL2Q14192 279 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 SLPIP03973 132 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 NUPR2A6NF83 97 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 J3KT08 172 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 AMELXQ99217 191 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 F8WDY8 70 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 Q6ZQY7 126 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 IGKV2D-28P01615 120 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1B0GUV1 79 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 CCKP06307 115 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 JMJD1CQ15652 2540 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A096LNI7 61 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 RETNQ9HD89 108 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 Q6ZTC4 211 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00694P0DN24 101 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 IMUPQ9GZP8 106 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 M0R2N4 97 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A096LNJ9 63 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 MT-ATP8P03928 68 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 LY6G6CO95867 125 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 UQCRQO14949 82 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 COX6A2Q02221 97 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 ENHOQ6UWT2 76 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 IGKV4-1P06312 121 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 Q6ZSN1 163 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 C2orf48Q96LS8 159 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 FHL3Q13643 280 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 NDUFC2O95298 119 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 LRRK2Q5S007 2527 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC01546A6NGU7 62 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 SCXQ7RTU7 201 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 KLK9Q2XQG4 91 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 USP17L23D6RBM5 183 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 C3orf84H3BNL1 204 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 M0QXV9 152 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 C5orf47Q569G3 176 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 C20orf197Q8N268 126 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms