RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TIRAPP58753 221 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ICOSQ9Y6W8 199 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAH8Q96JB1 4490 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 NFE4Q86UQ8 179 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2L6O14933 153 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MAJINQ3KP22 176 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 hDV102S1A0JD36 115 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP10-1P60331 282 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 Q5VSD8 79 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLC3P0DOY3 106 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM101Q96IK0 257 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PRO1933Q9H354 126 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GUV1 79 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5A1Q8NGJ0 315 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MIEN1Q9BRT3 115 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SIVA1O15304 175 aa16.23■□□□□ 0.19
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf88Q9BSF0 95 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAH10OSP0CZ25 163 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 STPG4Q8N801 248 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCR10Q9UDW1 63 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CHCHD5Q9BSY4 110 aa16.21■□□□□ 0.19
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CAPNS1-216ENST00000628306 LELP1Q5T871 98 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZUT4 128 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf86A6NJI1 115 aa16.19■□□□□ 0.18
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CAPNS1-216ENST00000628306 SEC11AP67812 179 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WTM6 91 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa16.18■□□□□ 0.18
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CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD39Q53RE8 183 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 COX8AP10176 69 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2D1P51668 147 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE6Q13070 117 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 LYPD5Q6UWN5 251 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0J9YXV3 536 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PLD3 99 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A34Q6PIV7 304 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf144Q96I85 54 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 HERVK_113P61574 105 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 EREGO14944 169 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL25O15444 150 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 BOD1L2Q8IYS8 172 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 RBX1P62877 108 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 HERVK_113P63121 156 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa16.1■□□□□ 0.17
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM170BQ5T4T1 132 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00242Q5T6M2 205 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa16.07■□□□□ 0.16
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CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00587B1AMM8 73 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GCSHP23434 173 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 NMUP48645 174 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MPV17L2Q567V2 206 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BRM9 83 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 HMCN2Q8NDA2 5059 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 LEPROTO15243 131 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHB2Q96CS7 222 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa16.01■□□□□ 0.15
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CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00469Q8N7U9 141 aa16.01■□□□□ 0.15
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CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 HIGD1BQ9P298 99 aa16■□□□□ 0.15
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CAPNS1-216ENST00000628306 K7EP13 123 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 COX6A2Q02221 97 aa16■□□□□ 0.15
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CAPNS1-216ENST00000628306 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01561Q8N1V8 128 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR34Q9NV39 138 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM229AH3BQW9 127 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 J3QQQ9 107 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM30AQ9NZY2 134 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CTAG1AP78358 180 aa15.96■□□□□ 0.15
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